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kjl3283

铜虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】groamcs模拟,二面角束缚设置 已有1人参与



我模拟一系统,想利用上面的第三项来束缚二面角,但是在gromacs设置时,遇到问题请指教:
在使用gromacs时候,如果用如上函数第三项来束缚二面角,但是涉及到参数multiplicity,也就是我下面的“?”
在这里实际选择了基准角为pi, 但是这个multiplicity该是多少啊?我看说明说,0-90取2,  0-180取1,我这样取了但是把系统给扭曲了,请大家指教,以下面例子请大侠给予详细说明,先谢了。
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   65   64   91   92   1   14.7614040        52.718    ?
   65   64   91   98   1  150.4772797       52.718    ?
   65   94   87   88   1  165.3720093       52.718    ?
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纳米器件设计
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孟广昊

木虫 (小有名气)

★ ★
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御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-18 17:05:16
你使用的力场中没有吗?往往力场中会有当多重度是1.2.3时不同情况对应的参数。
2楼2011-04-18 14:42:02
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孟广昊

木虫 (小有名气)

★ ★
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御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-18 17:05:24
把所有的情况都写在力场里,把f写成9,最新版本的gromacs可以写成这样
3楼2011-04-18 14:52:20
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