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dream1021

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[交流] 【求助】怎么做一个分子的红外光谱

求助高手，有没有人通过MD做出分子的红外光谱，应该怎么去跑MD？

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1楼 2011-04-13 09:52:17

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xinzhi

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RE

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dream1021(金币+2):谢谢参与
dream1021(金币+4): 2011-04-14 10:07:45
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-04-14 10:28:21

很容易的计算偶极-偶极相关函数即可IR= 可自己由MD所得数据编程来实现

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2楼2011-04-13 22:00:37

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Originally posted by xinzhi at 2011-04-13 22:00:37:
很容易的计算偶极-偶极相关函数即可IR=<miu(t)miu(0)> 可自己由MD所得数据编程来实现

谢谢哈，那MD应该怎么去设置？有什么特殊的的吗？

3楼2011-04-14 10:10:01

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xinzhi

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-15 23:34:46
dream1021(金币+4): 2011-04-19 09:35:15

引用回帖:

Originally posted by dream1021 at 2011-04-14 10:10:01:
谢谢哈，那MD应该怎么去设置？有什么特殊的的吗？

只要将位置速度等信息按一定时间间隔存下来如果采用电荷涨落模型的话同时存储电荷根据偶极距的定义即可求出

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4楼2011-04-15 22:21:53

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Originally posted by xinzhi at 2011-04-15 22:21:53:
只要将位置速度等信息按一定时间间隔存下来如果采用电荷涨落模型的话同时存储电荷根据偶极距的定义即可求出

谢谢哈，我现在只有位置速度等信息的储存，是不是必须要储存电荷？

5楼2011-04-19 09:34:37

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xinzhi

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-19 22:31:23

引用回帖:

Originally posted by dream1021 at 2011-04-19 09:34:37:
谢谢哈，我现在只有位置速度等信息的储存，是不是必须要储存电荷？

没关系如果你不是采用电荷涨落的方法的话，电荷不用存的建议找本分子光谱的书看看你就清楚了

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6楼2011-04-19 22:11:24

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Originally posted by xinzhi at 2011-04-19 22:11:24:
没关系如果你不是采用电荷涨落的方法的话，电荷不用存的建议找本分子光谱的书看看你就清楚了

恩，谢谢啦，你可以给我几篇关于MD模拟的光谱文献吗？不胜感谢哈

7楼2011-04-22 18:05:29

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