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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】怎么做一个分子的红外光谱
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dream1021

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】怎么做一个分子的红外光谱

求助高手，有没有人通过MD做出分子的红外光谱，应该怎么去跑MD？
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1楼 2011-04-13 09:52:17
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xinzhi

至尊木虫 (著名写手)

RE

★ ★ ★
dream1021(金币+2):谢谢参与
dream1021(金币+4): 2011-04-14 10:07:45
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-04-14 10:28:21
很容易的 计算偶极-偶极相关函数即可IR= 可自己由MD所得数据编程来实现
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2楼2011-04-13 22:00:37
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dream1021

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xinzhi at 2011-04-13 22:00:37:
很容易的 计算偶极-偶极相关函数即可IR=<miu(t)miu(0)> 可自己由MD所得数据编程来实现

谢谢哈，那MD应该怎么去设置？有什么特殊的的吗？
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3楼2011-04-14 10:10:01
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xinzhi

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-15 23:34:46
dream1021(金币+4): 2011-04-19 09:35:15
引用回帖:
Originally posted by dream1021 at 2011-04-14 10:10:01:
谢谢哈，那MD应该怎么去设置？有什么特殊的的吗？

只要将位置速度等信息按一定时间间隔存下来 如果采用电荷涨落模型的话 同时存储电荷 根据偶极距的定义即可 求出
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4楼2011-04-15 22:21:53
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dream1021

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xinzhi at 2011-04-15 22:21:53:
只要将位置速度等信息按一定时间间隔存下来 如果采用电荷涨落模型的话 同时存储电荷 根据偶极距的定义即可 求出

谢谢哈，我现在只有位置速度等信息的储存，是不是必须要储存电荷？
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5楼2011-04-19 09:34:37
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xinzhi

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-19 22:31:23
引用回帖:
Originally posted by dream1021 at 2011-04-19 09:34:37:
谢谢哈，我现在只有位置速度等信息的储存，是不是必须要储存电荷？

没关系 如果你不是采用电荷涨落的方法的话，电荷不用存的  建议找本分子光谱的 书看看  你就清楚了
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6楼2011-04-19 22:11:24
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dream1021

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xinzhi at 2011-04-19 22:11:24:
没关系 如果你不是采用电荷涨落的方法的话，电荷不用存的  建议找本分子光谱的 书看看  你就清楚了

恩，谢谢啦，你可以给我几篇关于MD模拟的光谱文献吗？不胜感谢哈
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7楼2011-04-22 18:05:29
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