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铁虫 (初入文坛)


[交流] 【求助】gromacs+mopac7进行量化计算得到的Quantum En.是什么能量?

我用gromacs+mopac7进行量化计算,请问得到的Quantum En.是哪一种能量?结合能?分子形成能? 这个Quantum Energy是要考察绝对值还是相对值?正负都可以吗?



我想A与B的结合能,先计算含有AB的体系,然后分别计算只有A只有B的体系,最后利用AB-(A+B)作为结合能可行吗?就用 Total Energy  这一项的值。


   Energies (kJ/mol)

           Bond                     Angle          Proper Dih.     Ryckaert-Bell.          LJ-14

    1.70519e+02    5.28085e+02    2.66347e+01    3.01682e+02    3.10993e+02

     Coulomb-14             LJ (SR)          Coulomb (SR)      Coul. recip.    Quantum En.

    1.15810e+03    6.93680e+04   -4.40889e+05   -3.80293e+04   -2.54819e+02

      Potential             Kinetic En.       Total Energy    Temperature   Pressure (bar)

   -4.07310e+05    7.39277e+04   -3.33382e+05    3.00010e+02    3.46045e-01

  Cons. rmsd ()

    0.00000e+00



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