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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】计算MP2时系统出现"read only file system”错误！
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shuo2008

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】计算MP2时系统出现"read only file system”错误！

使用的8核服务器16G内存，400G硬盘，CentOS5.4 Linux系统.利用Gaussian09计算30个原子的体系，使用的是MP2方法，在计算过程中生成了136G大小的文件，还有内存设置成了20G。硬盘设置成了400GB！
结果系统出现了"read only file system”错误！

Erroneoue read  Read 2008725432 instead of 2097152000
fd=4
g-read: Read only file system！


这个具体是什么原因呢？
1、是不是系统的问题？比如系统有Bug？
2、会不会是硬件问题？
3、软件的问题？生成的文件太大？还是内存的问题？

[ Last edited by shuo2008 on 2011-4-8 at 14:39 ]
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1楼 2011-04-08 12:20:05
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by shuo2008 at 2011-04-11 23:41:36:
把内存设置成14G就好了！ 并且计算的还挺快！ 看来是内存的事！！！

猜测一下：莫非是因为一开始设成20G，超过了本身的16G，所以多出来的那部分就不知该怎么办，导致出错...
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9楼2011-04-12 17:37:08
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小红豆(金币+2): 感谢交流 2011-04-08 14:29:21
没遇过这种问题，不过看描述应该是指该文件是只读文件，可能要把它改成可读写文件才行...

具体的操作应该是用 chmod +u 还是+w，记不太清，你可以上网搜一下...

这个问题应该是由于linux没设置好而产生的。

以上只是我的猜测，坐等高人出现...
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2楼2011-04-08 12:39:41
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shuo2008

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by fatpig8832 at 2011-04-08 12:39:41:
没遇过这种问题，不过看描述应该是指该文件是只读文件，可能要把它改成可读写文件才行...

具体的操作应该是用 chmod +u 还是+w，记不太清，你可以上网搜一下...

这个问题应该是由于linux没设置好而产生的。 ...

谢谢！ 这个文件是在程序运行中产生的！ 过了几天大小达到136G就会出现错误，然后程序就死掉了！ 并且出现了好几次，每次都得修复系统！还有利用MP2方法计算是不是对服务器有要求啊？
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3楼2011-04-08 14:22:39
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shuo2008

金虫 (正式写手)
自己顶一下！@@@@@@@@@@@
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4楼2011-04-09 19:08:22
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