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shuo2008

金虫 (正式写手)


[交流] 【求助】计算MP2时系统出现"read only file system”错误!

使用的8核服务器16G内存,400G硬盘,CentOS5.4 Linux系统.利用Gaussian09计算30个原子的体系,使用的是MP2方法,在计算过程中生成了136G大小的文件,还有内存设置成了20G。硬盘设置成了400GB!
结果系统出现了"read only file system”错误!

Erroneoue read  Read 2008725432 instead of 2097152000
fd=4
g-read: Read only file system!


这个具体是什么原因呢?
1、是不是系统的问题?比如系统有Bug?
2、会不会是硬件问题?
3、软件的问题?生成的文件太大?还是内存的问题?

[ Last edited by shuo2008 on 2011-4-8 at 14:39 ]
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
小红豆(金币+2): 感谢交流 2011-04-08 14:29:21
没遇过这种问题,不过看描述应该是指该文件是只读文件,可能要把它改成可读写文件才行...

具体的操作应该是用 chmod +u 还是+w,记不太清,你可以上网搜一下...

这个问题应该是由于linux没设置好而产生的。

以上只是我的猜测,坐等高人出现...
2楼2011-04-08 12:39:41
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shuo2008

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by fatpig8832 at 2011-04-08 12:39:41:
没遇过这种问题,不过看描述应该是指该文件是只读文件,可能要把它改成可读写文件才行...

具体的操作应该是用 chmod +u 还是+w,记不太清,你可以上网搜一下...

这个问题应该是由于linux没设置好而产生的。 ...

谢谢! 这个文件是在程序运行中产生的! 过了几天大小达到136G就会出现错误,然后程序就死掉了! 并且出现了好几次,每次都得修复系统!还有利用MP2方法计算是不是对服务器有要求啊?
3楼2011-04-08 14:22:39
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shuo2008

金虫 (正式写手)


自己顶一下!@@@@@@@@@@@
4楼2011-04-09 19:08:22
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shuo2008

金虫 (正式写手)


自己再顶一下!!!!!!!!!!!
5楼2011-04-10 08:53:00
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shuo2008

金虫 (正式写手)


自己再顶一下!!!!!!!!!!!
6楼2011-04-10 17:25:52
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shuo2008

金虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★
375642546(金币+1): 2011-04-12 08:25:42
小红豆(金币+3): 感谢交流 2011-04-12 11:10:16
把内存设置成14G就好了! 并且计算的还挺快! 看来是内存的事!!!
7楼2011-04-11 23:41:36
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by shuo2008 at 2011-04-11 23:41:36:
把内存设置成14G就好了! 并且计算的还挺快! 看来是内存的事!!!

猜测一下:莫非是因为一开始设成20G,超过了本身的16G,所以多出来的那部分就不知该怎么办,导致出错...
9楼2011-04-12 17:37:08
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简单回复
书万里8楼
2011-04-12 08:12   回复  
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