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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】watershell命令
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zhulijuan001

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】watershell命令

我用AMBER做完MD后，想要分析以某个原子为中心5埃内的水分子数，就用了watershell这个命令，可以得到每一帧的水分子数，但是对应到相应帧数的蛋白质，有DS打开，用SELECT取的时候，里面含有的水分子数就和AMBER算出来的不一样，不知道哪个地方错了？希望各位高手棒棒忙！谢谢！
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1楼 2011-04-01 10:07:55
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zhulijuan001

金虫 (小有名气)
原来是生成PDB文件的时候没有用center和image命令！
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2楼2011-04-13 16:31:11
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