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jianguo-

木虫 (著名写手)

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[交流] 【求助/交流】有关荧光原位杂交（FISH）的探针序列中的字母W是什么意思啊？

文献中看到某种细菌的探针，但是发现字母里面有个W，不是只有A、G、T、C四种核苷酸的吗？请大家帮我解释一下啊 CCGTCATCTACWCAGGGTATTAAC

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1楼 2011-03-30 13:12:20

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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★
jianguo-(金币+5): 非常感谢您 2011-04-01 08:01:45
dhd997(金币+6): good，联系区长了没有？ 2011-04-01 08:45:13

楼上正解，呵呵~W=A,T,U
附个代码表：
IUPAC ambiguity codes are single-letter codes for nucleotides and amino acids established by the International Union of Pure and Applied Chemistry. This nomenclature is used for specifying Pattern Search parameters.

Nucleotides (Cornish-Bowden, 1985):

Symbol Meaning
G G
A A
T T or U
C C
U U or T
R G or A
Y T, U or C
M A or C
K G, T or U
S G or C
W A, T or U
H A, C, T or U
B G, T, U or C
V G, C or A
D G, A, T or U
N G, A, T, U or C
Amino Acids:

1-Letter Symbol 3-Letter Symbol Meaning
A Ala Alanine
R Arg Arginine
N Asn Asparagine
D Asp Aspartic acid
C Cys Cysteine
Q Gln Glutamine
E Glu Glutamic acid
G Gly Glycine
H His Histidine
I Ile Isoleucine
L Leu Leucine
K Lys Lysine
M Met Methionine
F Phe Phenylalanine
P Pro Proline
S Ser Serine
T Thr Threonine
W Trp Tryptophan
Y Tyr Tyrosine
V Val Valine
B Asx Asparagine or Aspartic acid
Z Glx Glutamine or Glutamic acid
X ??? Unknown
Cornish-Bowden, A. (1985). Nomenclature for incompletely specified bases in nucleic acid sequences: recommendations 1984. Nuc. Acids Res. 13:3021-3030.