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【求助】优化:怎样找到一个两个分子之间的相对位置
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daiyulan85
木虫
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虫号: 1078645
[交流]
【求助】优化:怎样找到一个两个分子之间的相对位置
以前求助过,就是优化一个聚集体时,始终得不到正确的构型。要求就是两个分子之间的距离必须是3.9,有为高手指点过,加虚原子调试距离,然后固定优化。但是固定距离优化后,其相对位置就改变了。再多加些虚原子,固定相对位置,还是没有得到正确的构型。都是正常结束。请各位高手帮忙分析一下是什么原因,应该要怎么做。像这种聚集体会不会有专门调距离的方法呢?试着找过,但是没有找到
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1楼
2011-03-26 21:31:38
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天下枫叶
木虫
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虫号: 893453
★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by
daiyulan85
at 2011-03-26 21:31:38:
以前求助过,就是优化一个聚集体时,始终得不到正确的构型。要求就是两个分子之间的距离必须是3.9,有为高手指点过,加虚原子调试距离,然后固定优化。但是固定距离优化后,其相对位置就改变了。再多加些虚原子, ...
我也想逐步改变两分子间距离进行势能面扫描,但是不知道怎么调距离
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24楼
2011-07-14 20:06:38
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mchen10
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★ ★ ★ ★
daiyulan85(金币
+1
):谢谢参与
zhou2009(金币+3): 2011-03-28 09:47:55
daiyulan85(金币+5): 2011-03-28 11:08:42
375642546: 2011-04-18 23:08:24
楼主你的计算有几个问题
3.9的距离已经是中程/长程作用力了,我不认为计算得到的优化构型有很好的物理意义
楼主是不是要用计算结果和实验数据比较?3.9是不是从晶体结构数据来的?这便是第二个问题计算的结果是真空气相单分子的,简单的优化是无法模拟出晶体结构的
既然已经知道分子的结构了,就不要优化了,调整好分子间距离做一个能量计算,至少还能提供一点点有用的信息
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2011-03-28 09:07:55
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daiyulan85
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虫号: 1078645
引用回帖:
Originally posted by
mchen10
at 2011-03-28 09:07:55:
楼主你的计算有几个问题
3.9的距离已经是中程/长程作用力了,我不认为计算得到的优化构型有很好的物理意义
楼主是不是要用计算结果和实验数据比较?3.9是不是从晶体结构数据来的?这便是第二个问题计算的结 ...
3.9是一个实验数据,是别人做出来的,也试着找过是不是有晶体数据。我是想通过做这个分子的荧光来看分子之间的电子转移机理的。
再一个,你说的真空气相问题,是不是要加上溶剂?
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6楼
2011-03-28 11:08:23
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erinic
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daiyulan85(金币
+1
):谢谢参与
这个问题有待我进一步研究
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7楼
2011-03-28 18:28:03
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