| 查看: 2858 | 回复: 26 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】优化：怎样找到一个两个分子之间的相对位置
|
|||
以前求助过，就是优化一个聚集体时，始终得不到正确的构型。要求就是两个分子之间的距离必须是3.9，有为高手指点过，加虚原子调试距离，然后固定优化。但是固定距离优化后，其相对位置就改变了。再多加些虚原子，固定相对位置，还是没有得到正确的构型。都是正常结束。请各位高手帮忙分析一下是什么原因，应该要怎么做。像这种聚集体会不会有专门调距离的方法呢？试着找过，但是没有找到 |
回复此楼» 猜你喜欢
湖南大学招收锂离子电池、离子液体、高分子与凝胶材料、电催化方向博士生多名
已经有5人回复
-
半透性容器进行高湿或者低湿研究
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有167人回复
-
关于五水硝酸铋还原得到单质铋的问题
已经有1人回复
-
山东省青年基金什么时候拨款
已经有34人回复
-
CES投稿
已经有2人回复
-
如何掌握一门外语？
已经有0人回复
-
企业为什么一定要做“专精特新”认定？如何成为专精特新企业？
已经有5人回复
-
求助ASIQwin新版本的软件
已经有0人回复
-
期待科研合作，共同发表论文
已经有98人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 纸上谈药，一个畅销药的奋斗史（2）
已经有14人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 【整理】今天整理硬盘上的资料，偶然发现的好玩的小东西就直接发上来吧
已经有105人回复
- 【sobereva个人文集】电子定域性的图形分析
已经有56人回复
- 【在线答疑】关于NAMD/VMD
已经有210人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
中国海洋大学与中国水产科学研究院 联合培养 专硕 食品加工与安全
+1/78
-
2026博士申请——有机化学\计算化学\药物化学方向
+1/59
-
浙江师范大学申利国教授招聘博士后研究人员
+1/30
-
【招生啦招生啦】武汉理工大学朱曼副研究员招收2026年9月入学博士/硕士研究生
+1/30
-
暨南大学理工学院 光子技术研究院段宣明团队申请制读博招生
+1/30
-
盐湖所镁基储氢材料课题组招聘
+1/29
-
南科大夏海平院士-深大张平玉课题组联合招聘博士后
+1/28
-
中科大环境系张常勇教授课题组招聘副研/博士后（一人一议）
+1/18
-
天津大学化学系吴立朋课题组申请考核制博士招生/博后招聘-有机化学，金属有机
+1/12
-
2026年中科院化学所优青 程靓团队招收有机化学、生物化学背景的博士研究生
+1/12
-
国家青年人才叶立群教授课题组招收2026级博士研究生
+1/10
-
天津大学化学系吴立朋课题组申请考核制博士招生/博后招聘
+1/7
-
中国科学院大连化学物理研究所DNL0902研究组招聘博士后和职工
+1/6
-
北京理工大学-集成电路与电子学院-国家杰青团队-招博士后及科研助理
+1/6
-
[香港城市大学]电机工程系谭教授课题组-[二维材料光电子器件]-招收博士生
+1/5
-
南京林业大学”申请-考核”制学术学位博士研究生招生
+1/3
-
【博士招生】AI+材料/能源及海上能源岛方向有若干申请考核制名额
+1/3
-
中科院精密测量院（原武汉物数所）诚招磁共振成像方向申请考核制博士（2026.1.9截止）
+1/2
-
北京师范大学与企业联合招聘博士后、全职、兼职人员
+1/1
-
北京理工大学原子团簇团队博士后招聘公告（长期有效）
+1/1
|
请问您如何确定“氢键作用力”还是“π-π堆积作用”呢？是AIM分析的还是通过距离猜的？都是波函数的交叠而已，两者能有多大区别啊。楼主这个体系必然是氢键作用+范德华作用同时存在的。事实上楼主您不必非要硬去靠近实验化学那些粗糙而且违背科学道理的概念，您只要用轨道耦合（至少在您这种KS方程+波普尔基组的条件下）解释清楚两个分子之间的相互作用 就完事了 通过轨道耦合达到体系总能量的降低 这不就是咱们领域认为的分子相互作用的本质嘛 实验化学的概念往往是粗糙的、诡异的、不可信的、科学上有很大漏洞的 咱们领域的概念往往是严格的、自洽的、数学的、科学上严密的 [ Last edited by yjcmwgk on 2011-4-4 at 17:00 ] |
20楼2011-04-04 16:54:28
★ ★ ★ ★
daiyulan85(金币+1):谢谢参与
zhou2009(金币+3): 2011-03-28 09:47:55
daiyulan85(金币+5): 2011-03-28 11:08:42
375642546: 2011-04-18 23:08:24
daiyulan85(金币+1):谢谢参与
zhou2009(金币+3): 2011-03-28 09:47:55
daiyulan85(金币+5): 2011-03-28 11:08:42
375642546: 2011-04-18 23:08:24
|
楼主你的计算有几个问题 3.9的距离已经是中程/长程作用力了，我不认为计算得到的优化构型有很好的物理意义 楼主是不是要用计算结果和实验数据比较？3.9是不是从晶体结构数据来的？这便是第二个问题计算的结果是真空气相单分子的，简单的优化是无法模拟出晶体结构的 既然已经知道分子的结构了，就不要优化了，调整好分子间距离做一个能量计算，至少还能提供一点点有用的信息 |
4楼2011-03-28 09:07:55
6楼2011-03-28 11:08:23
7楼2011-03-28 18:28:03