| 查看: 3029 | 回复: 26 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】优化：怎样找到一个两个分子之间的相对位置
|
|||
以前求助过，就是优化一个聚集体时，始终得不到正确的构型。要求就是两个分子之间的距离必须是3.9，有为高手指点过，加虚原子调试距离，然后固定优化。但是固定距离优化后，其相对位置就改变了。再多加些虚原子，固定相对位置，还是没有得到正确的构型。都是正常结束。请各位高手帮忙分析一下是什么原因，应该要怎么做。像这种聚集体会不会有专门调距离的方法呢？试着找过，但是没有找到 |
回复此楼» 猜你喜欢
求助Amsterdam Density Functional
已经有4人回复
-
武汉纺织大学全国重点实验室陈嵘教授团队招收2026级学术/专业型硕士研究生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有176人回复
-
国家级人才课题组招收2026年入学博士
已经有1人回复
-
国家级人才课题组招收2026年入学博士
已经有0人回复
-
国家级人才课题组招收2026年入学博士
已经有0人回复
-
大连海事大学船舶洁净能源研究中心2026年博士研究生招生启事
已经有10人回复
-
cif求助下载
已经有1人回复
-
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有2人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 纸上谈药，一个畅销药的奋斗史（2）
已经有14人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 【整理】今天整理硬盘上的资料，偶然发现的好玩的小东西就直接发上来吧
已经有105人回复
- 【sobereva个人文集】电子定域性的图形分析
已经有56人回复
- 【在线答疑】关于NAMD/VMD
已经有210人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
医学超声影像负责人招聘-中国科学院赣江创新研究院
+1/975
-
西湖大学2026年秋季入学物理学、光学、电子信息方向博士生有名额速来！！！
+2/236
-
西湖大学拓扑光学、非厄米光学、太赫兹方向博士后招聘
+2/234
-
西湖大学2026年秋季入学物理学、光学、电子信息方向博士生有名额速来！！！
+2/220
-
坐标广州，征女友
+2/188
-
贺电中定位于“积极作用”，是不是对基金委工作不够满意？
+1/78
-
龙凤Tai——写给恋人的第100封情书
+1/75
-
国家级青年人才课题组招收2026级硕士研究生
+1/37
-
海南大学海洋技术与装备学院-科研助理招聘（可读博）膜分离水处理方向
+1/33
-
香港中文大学医学院 诚聘 研究助理教授 (医工结合/生物信息学方向)
+1/32
-
上海交通大学-宁波东方理工大学联合培养博士生 – 力学
+1/13
-
国家“双一流”建设高校-南京林业大学-国家级青年人才团队 招2026级申请考核制博士
+1/8
-
全奖博士 英国利物浦大学 × 台湾清华大学 联合培养
+1/7
-
澳科大招收2026年秋季药物递送/生物材料方向硕士研究生（3月5日18:00报名截止）
+1/6
-
怎么发布了求助贴了， 一发就转到删除栏了
+1/6
-
德国图宾根大学诚招全奖岗位制博士（地下流固化学反应耦合数值模拟方向）
+1/4
-
代教授（南昌航空大学）招收CO2光&光热催化还原方向的博士生
+1/3
-
国内树枝状聚合物现在进入量产了吗？
+1/3
-
代教授（南昌航空大学）招收CO2光&光热催化还原方向的博士生
+1/1
-
26博士申请
+1/1
|
请问您如何确定“氢键作用力”还是“π-π堆积作用”呢？是AIM分析的还是通过距离猜的？都是波函数的交叠而已，两者能有多大区别啊。楼主这个体系必然是氢键作用+范德华作用同时存在的。事实上楼主您不必非要硬去靠近实验化学那些粗糙而且违背科学道理的概念，您只要用轨道耦合（至少在您这种KS方程+波普尔基组的条件下）解释清楚两个分子之间的相互作用 就完事了 通过轨道耦合达到体系总能量的降低 这不就是咱们领域认为的分子相互作用的本质嘛 实验化学的概念往往是粗糙的、诡异的、不可信的、科学上有很大漏洞的 咱们领域的概念往往是严格的、自洽的、数学的、科学上严密的 [ Last edited by yjcmwgk on 2011-4-4 at 17:00 ] |
20楼2011-04-04 16:54:28
★ ★ ★ ★
daiyulan85(金币+1):谢谢参与
zhou2009(金币+3): 2011-03-28 09:47:55
daiyulan85(金币+5): 2011-03-28 11:08:42
375642546: 2011-04-18 23:08:24
daiyulan85(金币+1):谢谢参与
zhou2009(金币+3): 2011-03-28 09:47:55
daiyulan85(金币+5): 2011-03-28 11:08:42
375642546: 2011-04-18 23:08:24
|
楼主你的计算有几个问题 3.9的距离已经是中程/长程作用力了，我不认为计算得到的优化构型有很好的物理意义 楼主是不是要用计算结果和实验数据比较？3.9是不是从晶体结构数据来的？这便是第二个问题计算的结果是真空气相单分子的，简单的优化是无法模拟出晶体结构的 既然已经知道分子的结构了，就不要优化了，调整好分子间距离做一个能量计算，至少还能提供一点点有用的信息 |
4楼2011-03-28 09:07:55
6楼2011-03-28 11:08:23
7楼2011-03-28 18:28:03