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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】请教CNEB
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mzshchen

禁虫 (小有名气)
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1楼 2011-03-24 20:47:23
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-03-25 08:36:00
mzshchen(金币+5): 2011-03-28 22:55:22
引用回帖:
Originally posted by mzshchen at 2011-03-24 20:47:23:
请教各位大侠，我做CNEB时，用XCryden显示初末态的动画过程时，发现体系是在变大的，也就是原子扩散从初态到末态时，发现总的体系是在慢慢变大的，请问这样正常么？我用nebmake.pl做线性插值和cneb计算时没有固定 ...

你确定你的初态和末态的大小是一样的吗？你查看各个文件下的poscar看看吧，如果晶胞数值一样的话说明是看起来变大了而已，如果真的变大了最后怎么达到末态的呢？再减小吗？
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2楼2011-03-24 23:06:48
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mzshchen

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
3楼2011-03-28 22:58:54
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 谢谢讨论 2011-03-29 07:45:55
一般是充分驰豫的，表面计算可以要固定一部分原子
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-03-29 00:13:38
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
★
mzshchen(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by mzshchen at 2011-03-28 22:58:54:
我已检查了，是我始态 和末态的POSCAR有问题，谢谢你了！还有一个小小的问题想请教一些，做NEB时一般不用Selective dynamics吧？

也用 用于固定一部分原子
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6楼2011-03-29 08:17:45
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明月李

铜虫 (小有名气)
★
mzshchen(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-03-29 08:17:45:
也用 用于固定一部分原子

CNEb怎么做啊，需要设置很多POSCAR吗，可否给我一份你交到服务器的文件
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7楼2011-03-29 08:25:12
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维维Vivi

金虫 (著名写手)
★
mzshchen(金币+1):谢谢参与
同样学习
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8楼2011-03-29 08:36:18
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xmhyingyu

至尊木虫 (文坛精英)
★
mzshchen(金币+1):谢谢参与
bless！
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9楼2011-03-29 08:36:22
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xmhyingyu

至尊木虫 (文坛精英)
★
mzshchen(金币+1):谢谢参与
bless！
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10楼2011-03-29 08:36:27
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指点 2011-03-29 10:47:44
与一般的POSCAR没有任何区别呀……，只不过是要建几个文件夹，每个里面放一个。一般我们只得到初态和末态的POSCAR，然后用nebmake.pl来产生其他的POSCAR和那些文件夹
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13楼2011-03-29 09:02:26
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mzshchen

禁虫 (小有名气)
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14楼2011-03-29 19:22:53
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by mzshchen at 2011-03-29 19:22:53:
我发现初态和终态驰豫后的晶胞大小有些不同，所以看起来变大了，但是从动画过程来看，是我想要计算的过程，就是晶胞有变化，不知这样计算出来的结果合不合理？

不知道你到底做的什么东西 只能说有可能
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15楼2011-03-29 21:57:23
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葵cc_

木虫 (小有名气)
★
mzshchen(金币+1): 谢谢参与
请问有人知道怎么查看动态过程吗？
在计算CNEB得到结果之后，使用VTST的脚本命令nebresults.pl，并没有生成movie.xyz文件，生成的是movie.vasp和movie文件，生成的movie文件用VMD打不开，请问该如何查看动态的过程。
谢谢~~
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16楼2015-06-03 09:43:09
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简单回复
200025045楼
2011-03-29 00:48  
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z: 请不要在悬赏贴中纯表回复，请尊重求助者，相信你也不想在悬赏求助时得到这样的回复吧，警告一下，下次没收所得。 2011-03-29 07:47:07
引用回帖:
Originally posted by mzshchen at 2011-03-28 22:58:54: 我已检查了，是我始态 和末态的POSCAR有问题，谢谢你了！还有一个小小的问题想请教一些，做NEB时一般不用Selective dynamics吧？

mooncakeaa11楼
2011-03-29 08:38  
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z: 请不要在悬赏贴中纯表回复，请尊重发帖人，相信你也不想在求助时大家都纯表回复吧，谢谢合作，警告一下 2011-03-29 10:47:11
mooncakeaa12楼
2011-03-29 08:38  
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z: 请不要在悬赏贴中纯表回复，请尊重发帖人，相信你也不想在求助时大家都纯表回复吧，谢谢合作，再次警告，下次没收所得 2011-03-29 10:47:32
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