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mzshchen

禁虫 (小有名气)

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★ ★
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-03-25 08:36:00
mzshchen(金币+5): 2011-03-28 22:55:22
引用回帖:
Originally posted by mzshchen at 2011-03-24 20:47:23:
请教各位大侠,我做CNEB时,用XCryden显示初末态的动画过程时,发现体系是在变大的,也就是原子扩散从初态到末态时,发现总的体系是在慢慢变大的,请问这样正常么?我用nebmake.pl做线性插值和cneb计算时没有固定 ...

你确定你的初态和末态的大小是一样的吗?你查看各个文件下的poscar看看吧,如果晶胞数值一样的话说明是看起来变大了而已,如果真的变大了最后怎么达到末态的呢?再减小吗?
2楼2011-03-24 23:06:48
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mzshchen

禁虫 (小有名气)

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3楼2011-03-28 22:58:54
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★ ★
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 谢谢讨论 2011-03-29 07:45:55
一般是充分驰豫的,表面计算可以要固定一部分原子
4楼2011-03-29 00:13:38
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mzshchen(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by mzshchen at 2011-03-28 22:58:54:
我已检查了,是我始态 和末态的POSCAR有问题,谢谢你了!还有一个小小的问题想请教一些,做NEB时一般不用Selective dynamics吧?

也用 用于固定一部分原子
6楼2011-03-29 08:17:45
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明月李

铜虫 (小有名气)



mzshchen(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-03-29 08:17:45:
也用 用于固定一部分原子

CNEb怎么做啊,需要设置很多POSCAR吗,可否给我一份你交到服务器的文件
7楼2011-03-29 08:25:12
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维维Vivi

金虫 (著名写手)



mzshchen(金币+1):谢谢参与
同样学习
8楼2011-03-29 08:36:18
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xmhyingyu

至尊木虫 (文坛精英)



mzshchen(金币+1):谢谢参与
bless!
9楼2011-03-29 08:36:22
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xmhyingyu

至尊木虫 (文坛精英)



mzshchen(金币+1):谢谢参与
bless!
10楼2011-03-29 08:36:27
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★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指点 2011-03-29 10:47:44
与一般的POSCAR没有任何区别呀……,只不过是要建几个文件夹,每个里面放一个。一般我们只得到初态和末态的POSCAR,然后用nebmake.pl来产生其他的POSCAR和那些文件夹
13楼2011-03-29 09:02:26
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mzshchen

禁虫 (小有名气)

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14楼2011-03-29 19:22:53
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引用回帖:
Originally posted by mzshchen at 2011-03-29 19:22:53:
我发现初态和终态驰豫后的晶胞大小有些不同,所以看起来变大了,但是从动画过程来看,是我想要计算的过程,就是晶胞有变化,不知这样计算出来的结果合不合理?

不知道你到底做的什么东西 只能说有可能
15楼2011-03-29 21:57:23
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葵cc_

木虫 (小有名气)



mzshchen(金币+1): 谢谢参与
请问有人知道怎么查看动态过程吗?
在计算CNEB得到结果之后,使用VTST的脚本命令nebresults.pl,并没有生成movie.xyz文件,生成的是movie.vasp和movie文件,生成的movie文件用VMD打不开,请问该如何查看动态的过程。
谢谢~~
16楼2015-06-03 09:43:09
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简单回复
200025045楼
2011-03-29 00:48  
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z: 请不要在悬赏贴中纯表回复,请尊重求助者,相信你也不想在悬赏求助时得到这样的回复吧,警告一下,下次没收所得。 2011-03-29 07:47:07
引用回帖:
Originally posted by mzshchen at 2011-03-28 22:58:54: 我已检查了,是我始态 和末态的POSCAR有问题,谢谢你了!还有一个小小的问题想请教一些,做NEB时一般不用Selective dynamics吧?

mooncakeaa11楼
2011-03-29 08:38  
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z: 请不要在悬赏贴中纯表回复,请尊重发帖人,相信你也不想在求助时大家都纯表回复吧,谢谢合作,警告一下 2011-03-29 10:47:11
mooncakeaa12楼
2011-03-29 08:38  
mzshchen(金币+1):谢谢参与
zzy870720z: 请不要在悬赏贴中纯表回复,请尊重发帖人,相信你也不想在求助时大家都纯表回复吧,谢谢合作,再次警告,下次没收所得 2011-03-29 10:47:32
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