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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】谁能给个linux下能够让高斯作业一个一个完成的设置
汕头大学海洋科学接受调剂
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jjww0001

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】谁能给个linux下能够让高斯作业一个一个完成的设置

不想每次都去改批处理文件，想提交作业后根据进程中是否有高斯作业，如果有就挂起，如果没有高斯作业就提交的设置。
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1楼 2011-03-22 16:18:56
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mchen10

金虫 (正式写手)
jjww0001(金币+4): 谢谢 2011-03-24 14:15:46
建文件 run_g09 放在bin或$PATH里
run_g09内容：
for file in $@; do g09 ${file}  ${file%.gjf}.log; done

chmod +x run_g09.


使用方法:
run_g09 filename
run_g09 *gjf
run_g09 B*gjf
run_g09 [A-G]*gjf
run_g09 *singlet*gjf

etc.
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7楼2011-03-23 12:58:39
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风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)
jjww0001(金币+1): 能不能教下怎么搞？ 2011-03-23 12:28:04
这个需要用到调度系统
而且是帮顶过高斯的调度系统。。。
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3楼2011-03-22 16:53:42
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)
jjww0001(金币+2): 我是单机，自己就是管理员，不知道怎么设置，还要请教 2011-03-23 12:29:00
引用回帖:
Originally posted by jjww0001 at 2011-03-22 16:18:56:
不想每次都去改批处理文件，想提交作业后根据进程中是否有高斯作业，如果有就挂起，如果没有高斯作业就提交的设置。

这个要问集群的管理员，如果是自己组建，那就找个软件呗！我用PBS
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4楼2011-03-22 18:11:04
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stevenabing

至尊木虫 (正式写手)
jjww0001(金币+1): 这个会，但是每次要改这个，稍微麻烦了点 2011-03-23 12:29:54
把以下内容写在同一文件夹下（与要执行的文件）命名为bat_g09.sh，然后chmod +x bat_g09.sh，然后将所有要处理的文件*.gjf放在同一个文件夹中，执行./bat_g09.sh &  其实这是最简单的，还有很多方法的

#!/bin/bash
for inf in *.gjf
do
g09 ${inf}  ${inf%.gjf}.log
done
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5楼2011-03-23 08:12:21
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