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blizzard00

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】DNA纯化问题,求教师兄师姐 已有1人参与

我用CTAB法粗提DNA。而后用乙醇沉淀法纯化。纯化后测纯度,得结果是:A260/A280=1.84,A260/A230=1.86.各位师兄师姐还能帮忙分析一下实验结果?应该如何改进?
因为做到后来我拿PCR产物直接测序时发现总出问题,在排除了PCR本身的问题后,初步猜测应该是模板不纯的原因。请问应该如何改进纯化步骤才能使A260/A230=2呢?
本人刚开始做实验,经验不足,还请各位师兄师姐多多指教!
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生兴生物

银虫 (小有名气)


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PCR产物测序是什么问题?有没有从反向再测一下呢?
我个人觉得如果你直接送PCR产物去测序又总出问题的话,建议你将PCR产物克隆到载体上后再挑单克隆去测序,应该就好了。PCR产物直接测序是会出现一些问题的,比如出现双峰什么的。

如果你成功扩增出大小和预期一样的单一清晰PCR条带(产量够,不弥散),可以从胶上把目的条带切下来,然后提取PCR产物,送去测序,另外同意楼上意 见,建议一端测序出问题以后可以反向换引物测下,如果实在不行再做克隆,毕竟比较费时间。我从胶上纯出来的PCR产物,用的QIAGEN 试剂盒,大小约为300-400bp, 成功测出过几百个样本,大多数都没问题。
2楼2011-03-22 09:11:15
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