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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】关于预平衡的CA是否固定的问题
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crispsoft

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于预平衡的CA是否固定的问题

您好，我是刚刚接触NAMD的菜鸟。
有前辈说，在用NAMD做预平衡时，需要先固定CA碳做一次优化和平衡，然后再放开CA碳平衡一次。
我想问一下，如果不对CA固定，只做一次优化和平衡，会有什么问题啊？
我看很多文献也没说是做一次预平衡还是两次预平衡，是不是默认就得做两次？

谢谢！
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1楼2011-03-21 12:23:26
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bay__gulf

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
crispsoft(金币+2): 2011-03-21 17:05:13
ghcacj(金币+5): 谢谢 2011-03-22 12:18:54
都是些小技巧, 就是节省时间, 减少出错的小花招, 没必要提升的方法论的层面上.
http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=20604&page=1#pid94515
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2楼2011-03-21 12:54:14
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