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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】用于测试高性能服务器的gaussian算例
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fooo

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】用于测试高性能服务器的gaussian算例

单位最近买了台高性能服务器，要测试一下，哪位朋友可以提供一个算例啊？越大越好，不怕难算。说实在的，我真的想看看这服务器到底有多牛。
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1楼 2011-03-07 15:45:06
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yxcai

铁杆木虫 (著名写手)
★
fooo(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2011-03-07 15:45:06:
单位最近买了台高性能服务器，要测试一下，哪位朋友可以提供一个算例啊？越大越好，不怕难算。说实在的，我真的想看看这服务器到底有多牛。

一台服务器能牛到哪去，DFT能算400多个原子就行了
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2楼2011-03-07 18:07:27
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fooo

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yxcai at 2011-03-07 18:07:27:
一台服务器能牛到哪去，DFT能算400多个原子就行了

算大型机了吧？100多个内核。好像是浪潮TS10000。

[ Last edited by fooo on 2011-3-8 at 02:31 ]
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3楼2011-03-08 02:27:50
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风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)
★
fooo(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2011-03-08 02:27:50:
算大型机了吧？100多个内核。好像是浪潮TS10000。

[ Last edited by fooo on 2011-3-8 at 02:31 ]

十几个节点。。。
还不算大型机

如果算的话
中国大型机就太多太多了
算小规模集群吧
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4楼2011-03-08 09:16:27
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mchen10

金虫 (正式写手)
★
fooo(金币+1):谢谢参与
用gaussian真的测不出来.. 并行是出了名的弱

烧处理器用MOLPRO
测并行用nwchem

实在要测的话 跑个大点的MP2或CCSD(T)，至于多大，就要看机子有多少内存了
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5楼2011-03-08 09:28:30
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tangbohejin

木虫之王 (文学泰斗)
★
fooo(金币+1):谢谢参与
买一台这麽好的机器。。
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6楼2011-03-08 09:38:44
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fooo

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 风间的记忆 at 2011-03-08 09:16:27:
十几个节点。。。
还不算大型机

如果算的话
中国大型机就太多太多了
算小规模集群吧

呵呵，我目前还真不知道是什么样的配置，还没看见它的庐山真面目呢，不过以前听领导说预算要一两百万，应该不会是太差的机器吧。
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7楼2011-03-08 14:15:07
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
★
fooo(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2011-03-08 02:27:50:
算大型机了吧？100多个内核。好像是浪潮TS10000。

[ Last edited by fooo on 2011-3-8 at 02:31 ]

就算有1000个核，用Gaussian也测不出它的性能，Gaussian的并行效率在那摆着呢，超过16个核，Gaussian恐怕就歇菜了。用NWChem测试还差不多
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8楼2011-03-08 18:25:15
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fooo

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by pwzhou at 2011-03-08 18:25:15:
就算有1000个核，用Gaussian也测不出它的性能，Gaussian的并行效率在那摆着呢，超过16个核，Gaussian恐怕就歇菜了。用NWChem测试还差不多

是啊，Gaussian的并行效率是一种被人诟病的，可能gaussian以后应该改写一下他们的并行代码了。不过现在对于我们而言，采用16CPU做并行，真的是种奢望。所以我对这种机器还是比较期待的。
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9楼2011-03-09 02:19:54
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风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2011-03-08 14:15:07:
呵呵，我目前还真不知道是什么样的配置，还没看见它的庐山真面目呢，不过以前听领导说预算要一两百万，应该不会是太差的机器吧。

200万 有人可以买IBM 64把刀+IB+集群管理软件
同样200万 有人却只能买曙光32个节点+万兆网

PS：LS几位说的很对 高斯就是单机内并行可以 多机并行就是悲剧
虽然现在可以利用MPI做并行 但懂的人太少 效率还不算太出色

集群在我看来性能算一个指标
但最大的指标应该是多任务 多人高负载计算下的稳定性~~
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10楼2011-03-09 09:52:44
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fooo

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 风间的记忆 at 2011-03-09 09:52:44:
200万 有人可以买IBM 64把刀+IB+集群管理软件
同样200万 有人却只能买曙光32个节点+万兆网

PS：LS几位说的很对 高斯就是单机内并行可以 多机并行就是悲剧
虽然现在可以利用MPI做并行 但懂的人太少 效率还不 ...

这是领导的事了。其实花冤枉钱的事又岂止一件，多了去了！
不过就目前来讲，这样的服务器对于我们而言，应该是够用了。
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11楼2011-03-09 16:15:00
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yxcai

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2011-03-08 14:15:07:
呵呵，我目前还真不知道是什么样的配置，还没看见它的庐山真面目呢，不过以前听领导说预算要一两百万，应该不会是太差的机器吧。

领导太黑了还是太无知，多花不止一倍价格
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12楼2011-03-09 17:52:59
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风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2011-03-09 16:15:00:
这是领导的事了。其实花冤枉钱的事又岂止一件，多了去了！
不过就目前来讲，这样的服务器对于我们而言，应该是够用了。

心态不错。。。
其实术业有专攻
领导哪里懂这么多集群知识
又哪里知道每台服务器的报价一般比真正的价格高上许多
吃亏就是肯定的
但本人是否真的‘吃亏’就很难讲了
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13楼2011-03-10 09:15:24
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fooo

金虫 (正式写手)
最近测试了一把这个集群，gaussian09，8CPU并行计算，计算体系一共4个原子，大约500个基函数，CCSD(T)算法，使用了16G内存，算个了单点，耗时12000分钟（CPU时间）。大家评价一下怎么样？我的感觉是至少我敢算大作业了。
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14楼2011-04-26 04:00:41
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