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crispsoft

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】请大家指教这个表面静电势图VMD是怎样画出的已有2人参与

请大家指教这个表面静电势图是怎样画出的？
是VMD画的吗？
谢谢大家

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1楼 2011-03-04 16:56:25

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crispsoft

金虫 (小有名气)

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可能不是

我刚才又查了下，可能是先通过别的工具计算后载入到VMD中的。
我看有网站说
to visualize the electrostatic potential mapped onto a molecular surface, you need the latest version of VMD (currently 1.8.3) and then create your molecular surface visualization and load the data of the electrostatic potential into the same molecule as volumetric dataset
——似乎是先用别的算好了再载入到VMD里面
但是用什么呢？APBS吗？

还有，就是这个paper还把这个带表面静电势的东东继续做分子动力学模拟，我看他文章后附的资料有 video
http://www.ploscompbiol.org/arti ... ournal.pcbi.1000939

顺便问一下：APBS算的结果能发文章吗？

[ Last edited by crispsoft on 2011-3-4 at 17:57 ]