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shajun

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那央芯微反应器


[交流] 【求助/交流】“将感受态细胞和DNA混合物冰浴30min”的作用是什么?已有7人参与

求教各位前辈:
大肠杆菌化学转化法,其中有一个步骤:“将感受态细胞和DNA混合物冰浴30min”,请问各位,这个过程的作用是什么?
目的是“使细胞和DNA充分混合吗”?
如果是,请问只有实现了这个充分混合就可以吗,而不考虑时间的长度?比如1 s 就实现了充分混合,还需要再孵育吗?
注释:微流控芯片技术可以实现两种液体的瞬间混合,比如0.1 s 。

补充:根据虫友“woshishao” 给我的三个假说,其在说明一个问题,就是这个30min的孵育过程是为了让DNA和细胞上的LPS结合,这样,在随后的热激促使细胞吞下DNA-LPS复合物(this incubation was equivalent to the time of DNA adsorption to the competent cells)。
但是这不是我想要的答案,我的问题是:DNA结合到细胞上为什么需要这么久?其原因是不是因为DNA扩散到细胞表面需要这么久?
因为我们知道,如果DNA和细胞足够近的话,其结合(相当于化学反应)是相对快的,可以说是瞬间完成。当然对于这一点,也是我的猜测,根据是免疫分析也是大分子反应,孵育过程长(2h),这个过程就是一个扩散过程;而当在微流控芯片上完成这个过程时,就需要5s,因为微流控芯片上的快速混合。
因此我据此猜想,DNA与细胞的这个30min的孵育过程也是为两者的扩散接触;如果能够在0.1s内实现这个过程的话,其形成DNA-LPS复合物的过程就可以在0.1s内完成。
请各位学者专家拍砖!

[ Last edited by shajun on 2011-3-3 at 20:18 ]
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brightfuture01

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★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1): 很辛苦的说 2011-03-03 18:35:09
呵呵,虽然其机理到现在还不清楚,但是肯定不是你想象的那样的。有可能的原因是使菌体在此期间内恢复一定的代谢活力,但是代谢活力又不能太高。同时还要让菌体保持在较低温度,让其细胞壁不像刚拿出来那么脆又不至于太皮实,以为下一步热激做准备。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2011-03-03 17:51:27
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woshishao

金虫 (初入文坛)

现在貌似还只有假说解释

★ ★ ★ ★
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lstt09nk(金币+3): 鼓励交流,欢迎常来 2011-03-03 18:35:29
给你几个假说:
1.半个小时冰浴,是为了让加入的质粒与细胞表面的脂多糖发生结合,从而粘附在细胞表面。从而在热激后进入细胞。
参考文献:
Mechanism of artificial transformation of E. coli with plasmid DNA: Clues from the influence of ethanol
SARKAR Suchitra ; CHAUDHURI Sujan ; BASU Tarakdas

2.Ca能与加入的DNA分子结合,形成抗脱氧核糖核酸酶的羟基-磷酸钙复合物,黏附在胞膜的外表面
来源:网络,具体忘记了

3.One proposed hypothesis is that DNA crosses through the least-barrier path at zones of adhesion, where the outer and inner cell membranes fuse to pores in the cell wall. The zones of adhesion are rich in negatively-charged lipo polysaccharide (LPS) molecules and DNA also being negatively charged, cannot enter the cell easily as the two negative polarities repel each other. A divalent cation such as calcium, is believed to form stable coordination complexes with phosphates, and thus may facilitate the association of the two phosphate-rich structures like DNA and LPS.
参考文献:
DNA Science: A First Course in Recombinant DNA Technology, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1990, pp. 26–29.

最后一种假说,我偷懒,楼主自己翻译下吧。
3楼2011-03-03 18:16:59
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brightfuture01

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引用回帖:
Originally posted by woshishao at 2011-03-03 18:16:59:
给你几个假说:
1.半个小时冰浴,是为了让加入的质粒与细胞表面的脂多糖发生结合,从而粘附在细胞表面。从而在热激后进入细胞。
参考文献:
Mechanism of artificial transformation of E. coli with plasmid  ...

受教了
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2011-03-03 18:19:41
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

将dna吸附于细胞表面,便于转化
风雪夜归人
5楼2011-03-03 18:32:35
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wanghuiyanyx

金虫 (著名写手)



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应该是使DNA充分附着于细胞表面,在42度热激时就可以进入细胞。
6楼2011-03-03 19:06:14
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shajun

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那央芯微反应器


引用回帖:
Originally posted by woshishao at 2011-03-03 18:16:59:
给你几个假说:
1.半个小时冰浴,是为了让加入的质粒与细胞表面的脂多糖发生结合,从而粘附在细胞表面。从而在热激后进入细胞。
参考文献:
Mechanism of artificial transformation of E. coli with plasmid  ...

以上假说在说明一个问题,就是这个30min的孵育过程是为了让DNA和细胞上的LPS结合,这样,在随后的热激促使细胞吞下DNA-LPS复合物(this incubation was equivalent to the time of DNA adsorption to the competent cells)。
但是这不是我想要的答案,我的问题是:DNA结合到细胞上为什么需要这么久?其原因是不是因为DNA扩散到细胞表面需要这么久?
因为我们知道,如果DNA和细胞足够近的话,其结合(相当于化学反应)是相对快的,可以说是瞬间完成。当然对于这一点,也是我的猜测,根据是免疫分析也是大分子反应,孵育过程长(2h),这个过程就是一个扩散过程;而当在微流控芯片上完成这个过程时,就需要5s,因为微流控芯片上的快速混合。
因此我据此猜想,DNA与细胞的这个30min的孵育过程也是为两者的扩散接触;如果能够在0.1s内实现这个过程的话,其形成DNA-LPS复合物的过程就可以在0.1s内完成。
请各位学者专家拍砖!
7楼2011-03-03 20:16:29
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xiangxingwei

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不要追究这个了。你可以试一下一秒后热激的效率啊
nothingisimpossible
8楼2011-03-03 20:38:22
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shajun

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那央芯微反应器


引用回帖:
Originally posted by xiangxingwei at 2011-03-03 20:38:22:
不要追究这个了。你可以试一下一秒后热激的效率啊

你说到点子上了,这不是先有理论依据或假说,才进行试验的吗?毕竟,实验不是一件很好玩的事情~
9楼2011-03-03 20:53:32
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xiangxingwei

金虫 (正式写手)


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上面说的理论依据是目前比较权威的
nothingisimpossible
10楼2011-03-04 10:02:06
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