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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】linux下做频率计算报错,好像是内存问题。。 已有5人参与

任务是
%chk=doac-c2h2.chk
%mem=8MW
%nproc=1
# freq mp2/6-311+g geom=connectivity
错误提示内存不够,至少10MW
我就改成了
%chk=doac-c2h2.chk
%mem=10MW
%nproc=1
# freq mp2/6-311+g geom=connectivity
但还是报错,错误信息是
Disk-based method using ON**2 memory for 36 occupieds at a time.
Permanent disk used for amplitudes=   136758412 words.
Estimated scratch disk usage=  1050267586 words.
Actual    scratch disk usage=  1045563330 words.
Not enough memory for best loop length:
LenScr=     3948334 LenERI=     3000000 MOrb=  36 NBasFn= 263
NDiv=   69169 NHalf=   51 MxRSFn=  16 RSMin=   51 GoodMem=    10055238
Increasing memory by up to     6106904 words may improve performance.
Not enough memory to run at all:  LenERI=     3000000
Increase memory by     1265074 words.
Error termination via Lnk1e in /home/program/g03/l906.exe at Sun Feb 27 12:38:13 2011.
Job cpu time:  0 days  0 hours  9 minutes 44.6 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   9113 Int=      0 D2E=      0 Chk=     13 Scr=      1
应该怎么解决呢,已经是在linux下计算了
诚求大家帮忙解决
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auybv

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
频率计算对内存的要求非常高,何况还是MP2。像你那种50个原子的体系,我们这里计算频率一般分配6G内存,结果都用的满满的。所以你们计算频率的时候,除了留一小部分内存给系统以及其它程序,剩下的全部给Gaussian计算就行了。
11楼2011-03-04 15:50:45
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jjww0001

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
好像是说硬盘容量不够。10位数的words差不多是10g,不知道你硬盘是多大?尝试加上maxdisk=20g看看,另外看你的设置,好像机器不够强大啊,内存设置为什么不用mb呢,把所有空余的内存都设置到mem里(例如%mem=3000mb),我不熟悉1mw到底是多少兆内存,虽然gauss自己喜欢用mw。

[ Last edited by jjww0001 on 2011-2-27 at 14:08 ]
2楼2011-02-27 14:03:47
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by jjww0001 at 2011-02-27 14:03:47:
好像是说硬盘容量不够。10位数的words差不多是10g,不知道你硬盘是多大?尝试加上maxdisk=20g看看,另外看你的设置,好像机器不够强大啊,内存设置为什么不用mb呢,把所有空余的内存都设置到mem里(例如%mem=300 ...

1MW等于8 兆
是曙光超级计算机。。。应该硬件没问题吧。。
3楼2011-02-27 14:22:45
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)

别沉了,还没解决呢,大家帮帮忙
4楼2011-02-27 20:31:16
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