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sxxuan

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】请大家帮忙分析一下PCR结果,谢谢! 已有9人参与

做PCR扩增,结果出现如图的情况,我都不知道怎么分析了,请大家帮帮忙,谢谢!
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你的日子如何,你的力量也必如何!
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woshishao

金虫 (初入文坛)

经验分享与讨论

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare(金币+3): 鼓励新虫参与 2011-02-25 13:00:41
首先问楼主个问题,你的电泳跑时电压时多少?
然后对于楼主的PCR电泳图,我也出现过类似的情况。
经过个人总结,简称“涂布状条带”。
产生原因:1.PCR引物特异性不足,PCR扩增产生很多杂带,在电泳时如果使用大电压,  如120V,130V时PCR条带会跑的很宽,以至于和杂带连接成一片成涂布状。
解决方法:1.使用80V左右电压跑,你可以发现PCR条带都被压的很密集,非特异性扩增和目的条带分的很开,不管分析还是回收都可以说明了。不过为了数据漂亮,最好重设引物。

产生原因:2.凝胶没有凝好就跑电泳了,迁移率有问题,故出现上述情况。
解决方法:2.让凝胶凝集时间最好有20分钟-30分钟。

产生原因:3.模板污染,一般是污染了基因组DNA,导致相对引物特异性降低,扩增出很多条带。
解决方法:3。操作严谨,不要污染!个人觉得这个原因,一般注意了就不会出现。
12楼2011-02-25 12:56:54
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love_st

金虫 (著名写手)


★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
说详细点啊,片段多大等等
2楼2011-02-24 16:50:04
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sxxuan

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by love_st at 2011-02-24 16:50:04:
说详细点啊,片段多大等等

不好意思啊没说清楚。
这是由两个模板拼接在一起的,片段大小450左右,marker是100bp的~
你的日子如何,你的力量也必如何!
3楼2011-02-24 17:20:40
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
翱宇(金币+1): 鼓励交流 2011-02-24 19:54:20
这拖尾现象也太严重了,或者说DNA已经被破坏成梯度化
风雪夜归人
4楼2011-02-24 19:06:37
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