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xiamr

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】AMOVA 分子方差分析 已有6人参与

大家好 遇到 软件上的头疼事 请大家帮个忙 我现在进行AMOVA  分子方差分析,不知道 怎么用Arlequin 这个软件 请大家赐教!!

越详细越好,从序列的分析开始》》》 haha-1996@163.com
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无风的小屋

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
方差分析是ANOVA吧!!
Nocross,nocrown.
2楼2011-02-24 15:21:21
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xiamr

金虫 (小有名气)

你会算吗?
给讲讲 可以加我QQ 280262040谢谢
3楼2011-02-24 15:48:02
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xiamr

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 无风的小屋 at 2011-02-24 15:21:21:
方差分析是ANOVA吧!!

会算吗? 教下我
4楼2011-02-24 15:48:26
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people1845

铁虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也想知道

小木虫上给人解答专业问题的太少了
5楼2011-03-08 15:28:39
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gaoyang636

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可以找一本生物统计学书看一看~我也不大清楚,友情帮顶了~不过的确是ANOVA,是个缩写~
6楼2011-03-10 18:39:57
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xiamr

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gaoyang636 at 2011-03-10 18:39:57:
可以找一本生物统计学书看一看~我也不大清楚,友情帮顶了~不过的确是ANOVA,是个缩写~

和那个生物统计上的不一样,做地理种群的就用AMOVA
7楼2011-03-10 20:04:58
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ko0ko0

铁虫 (小有名气)

DNA数据Arlequin预处理格式,希望对各位有帮助


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
[Profile]

     Title="mtDNA sequences in the Senegalese Mandenka (hypervariable region 1)"

         #Data from :
         #Graven, L., Passarino, G., Semino, O., Boursot, P., Santachiara-Benerecetti, A. S.,
         #Langaney, A., and Excoffier, L., 1995, Evolutionary correlation between
         #control region sequence and RFLP diversity pattern in the mitochondrial genome
         #of a Senegalese sample, Mol. Biol. Evol. 12(2):334-345
(#后的文字是提示,软件不读取)
     NbSamples=1
                  GenotypicData=0
                  DataType=DNA
                  LocusSeparator=NONE
                MissingData='?'(将GAP换成?或者将这里的?换成-,要统一)

[Data]

     [[Samples]]

                SampleName="Mandenka"
                   #Reference: Graven et al. 1995 Mol. Biol. Evol. 12:334-345.
                   SampleSize=8(序列总个数)                   SampleData= {
名称  个数   序列(不知道为什么发言框里自动换行了,但是编辑时一个序列一行,不要换行)
01      6     ATTAGCACCCAAAGCTAAGATTCTAATTTAAACTATTCTCTGTTCTTTCATGGGGA GCAGATTTGGGTACCACCCAAGTATTGACTCACCCATCAACAACCGCTATGTATTTCGTACATTACTGCCAGCCACCATGAATATTGTACGGTACCATAAATACTTGACTATCTGTAGTACATAAAAACCCAAT--CCACATCAAAA-----CCCCCTCCCCATGCTTACAAGCAAGTACAGCAATCAACCTTCAACTATCACACATCAACTGCAACTCCAAAGCCA-CCCCTCACCCACTAGGATATCAACAAACCTACCCATCCTTAACAGTACATAGTACATAAAGCCATTTACCGTACATAGCACATTACAGTCAAATCCTTTCTCGTCCCCATGGATGACCCCCC
02   2     ???????????????????????????????????????????TCTTTCATGGGGAAGCAGATTTGGGTACCACCCAAGTATTGACTCACCCATCAACAACCGCCATGTATTTCGTACATTACTGCCAGCCACCATGAATATTGTACGGTACCATAAATACTTGACCACCTGTAGTACATAAAAACCCAAT--CCACATCAAAA-----CCCCCTCCCCATGCTTACAAGCAAGTACAGCAATCAACCTTCAACTATCACACATCAACTGCAACTCCAAAGCCA-CCCCTCACCCACTAGGATATCAACAAACCTACCCATCCTTAACAGTACATGGTACATAAAGCCATTTACCGTACATAGCACATTACAGTCAAATCCCTTCTCGTCCCCATGGATGACCCCC?
                            }
        [[Structure]]

                StructureName="New Edited Structure"
                NbGroups=1

                Group={
                        "Mandenka"
                }

按照这个格式,文件是可以识别的
8楼2011-03-30 17:01:42
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9楼2012-03-19 19:03:58
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