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【求助】求助DS中common feature pharmacophore方面的文献
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各位大侠好: 想做药效团这一块,但是因为蛋白比较新,比较单薄,没有小分子数据库支持,只有一个晶体小分子的结构,确定与其有作用,现在已经用DS中common feature pharmacophore这一块对小分子做了一个药效团的模型。 针对这个药效团,各位能不能提供一些相关的文章让我见识一下,因为它比较不同于往常的药效团,所以不知道接下来应该如何开展工作? 主要遇到的问题是:1、如何将药效团与其他结构不同的活性分子进行有效叠合,说明分子有效性 2、药效团接下来可以去搜寻数据库吗,这个药效团是基于对接以后的小分子构型产生的,通过GOLD软件对接,以及与晶体复合物对比,基本可以确定其构型而产生的药效团,所以它是不是在对接其他分子时有说服力 希望大家能够关注帖子一下,或者提供一些相关文献,不甚感激,知道大家不是冲金币来的,但愿意提供大把金币宫讨论。谢谢啦。 |
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肥鸡跳舞(金币+15): 真心的非常感谢你,我会好好阅读的,希望下次跟你再讨论!谢谢! 2011-02-26 10:15:41
zh1987hs(金币+5): 谢谢 2011-02-26 22:46:22
肥鸡跳舞(金币+15): 真心的非常感谢你,我会好好阅读的,希望下次跟你再讨论!谢谢! 2011-02-26 10:15:41
zh1987hs(金币+5): 谢谢 2011-02-26 22:46:22
![]() 用common feature pharmacophore见药学团步骤很简单,原理也很简单,你看看DS说明书就能搞定,我提供一篇文献供参考(http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=10682194l49i6wcb8jr3cq8z )。问题一,DS本身可以解决,见说明书。问题二,不妨可以试试对接后的POSE再叠合,但你要适当注意对接结果的可靠性。 |
2楼2011-02-26 09:51:33











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