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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】求助 Sybyl 动力学 问题
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qbin1304

新虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求助 Sybyl 动力学 问题 已有2人参与

看到文献上分子对接前利用Sybyl处理蛋白受体，处理中有个动力学过程，好像是只将质子做动力学了，请问可以这样做吗，在在sybyl中是怎么设置的，我在sybyl设动力学的参数的地方没看到有具体质子的地方。
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1楼 2011-02-18 15:57:58
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wnzhao

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-02-20 21:29:05

可以先选择重原子，然后反选（invert），那么这样就选定了H原子，之后可以仅对H进行操作了。
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2楼2011-02-19 16:26:03
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qbin1304

新虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wnzhao at 2011-02-19 08:26:03:
可以先选择重原子，然后反选（invert），那么这样就选定了H原子，之后可以仅对H进行操作了。

好像不能只对选中的进行动力学吧
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3楼2011-02-22 13:46:14
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