24小时热门版块排行榜    

查看: 460  |  回复: 3

nufang19a

金虫 (正式写手)


[交流] 【讨论】关于矩阵变换构成四聚体 已有2人参与

在我查看的pdb文件里有这样一段文字说明,


我需要构建四聚体,各位高手看我写的对不对:
mol load pdb 1YMG.pdb
set all [atomselect top all]
$all set segname A
$all writepdb AQP1-A.pdb
$all delete

set sel [atomselect top all]
$sel set segname B
$sel move {{-1.0 0.0 0.0 0.0} {0.0 -1.0 0.0 110.531} {0.0 0.0 1.0 0.0} {0.0 0.0 0.0 1.0}}
$sel writepdb AQP1-B.pdb
$sel delete

mol delete top
mol load pdb 1YMG.pdb
set sel [atomselect top all]
$sel set segname C
$sel move {{0.0 -1.0 0.0 55.2655} {1.0 0.0 0.0 55.2655} {0.0 0.0 1.0 0.0} {0.0 0.0 0.0 1.0}}
$sel writepdb AQP1-C.pdb
$sel delete

mol delete top
mol load pdb 1YMG.pdb
set sel [atomselect top all]
$sel set segname D
$sel move {{0.0 1.0 0.0 -55.2655} {-1.0 0.0 0.0 55.2655} {0.0 0.0 1.0 0.0} {0.0 0.0 0.0 1.0}}
$sel writepdb AQP1-D.pdb
$sel delete

cat AQP1-A.pdb AQP1-B.pdb AQP1-C.pdb AQP1-D.pdb > AQP1.pdb
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-02-16 13:09:01
2楼2011-02-14 22:07:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nufang19a

金虫 (正式写手)


解决了,在教程中有一段话:


[ Last edited by nufang19a on 2011-2-14 at 22:12 ]
3楼2011-02-14 22:11:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nufang19a

金虫 (正式写手)


谢谢wally8962   的回复,谢谢您的关注与回复
4楼2011-02-14 22:15:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 nufang19a 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 302求调剂 +8 呼呼呼。。。。 2026-03-17 8/400 2026-03-18 09:07 by 无际的草原
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +8 曦熙兮 2026-03-15 8/400 2026-03-17 20:31 by xilongliang
[考研] 341求调剂 +5 捣蛋猪猪 2026-03-11 7/350 2026-03-17 19:09 by 捣蛋猪猪
[考研] 268求调剂 +8 一定有学上- 2026-03-14 9/450 2026-03-17 17:47 by laoshidan
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +3 小李0854 2026-03-16 3/150 2026-03-17 13:40 by 热情沙漠
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] (081700)化学工程与技术-298分求调剂 +12 11啦啦啦 2026-03-11 35/1750 2026-03-13 21:25 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂! +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 283求调剂,材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
[考研] 321求调剂(食品/专硕) +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
信息提示
请填处理意见