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Gina88

木虫 (正式写手)

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[交流] 【求助完毕】程序表示什么意思？

以下的程序有些细节还是不知道什么意思。

#！bin/sh             #！什么意思啊？
rm WAVECAR       为什么要删除WAVECAR啊？
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat >INCAR< < SYSTEM=Si
ENCUT=$i             $什么意思啊？
ISTART=0
ICHARG=2
ISMEAR=-5
PREC=Accurate
!                               ！什么意思啊？
echo "ENCUT=$i eV"    什么意思啊
time vasp                   是让跑vasp的意思吗？
E='grep "TOTEN" OUTCAR |tail -1 | awk' {printf "%12.6f \n",$5}          什么意思啊
echo $i  $E >>comment          是将i  E的数值输入到comment文件中吗？
done

[ Last edited by cenwanglai on 2011-3-27 at 21:57 ]

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1楼 2011-01-25 17:48:20

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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★
Gina88(金币+10): 2011-01-25 21:05:21
ellsaking(金币+3): 感谢详细说明 2011-01-26 10:52:02

建议楼主了解一些linux脚本的基本知识

#！bin/sh             #！shell类型说明，使用的shell是bash
rm WAVECAR       删掉波函数，是为了从新开始弛豫（使用随机波函数）。如果INCAR中设置ISTART=0可以不用删除WAVECAR
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat >INCAR< SYSTEM=Si
ENCUT=$i             $i表示该处的值用i的值取代，即150，200,250.....
ISTART=0
ICHARG=2
ISMEAR=-5
PREC=Accurate
!                               前面已经解释过
echo "ENCUT=$i eV"    屏幕上打印引号内的内容，同上，$i用i的值取代
time vasp                   运行vasp，并且在程序跑完之后打印消耗的时间
E='grep "TOTEN" OUTCAR |tail -1 | awk' {printf "%12.6f \n",$5}
这一行你要学习grep，tail，awk和管道符号
grep是从文件中提取含有特殊字符的行，在这里是提取OUTCAR中含有TOTEN的行，通过管道符号，将提取出来的这些行交给下一个命令tail -1处理。
tail加一个负数表示显示最后几行，这里-1就是显示最后第一行，同样经过管道符号交给下一个命令处理。
awk是一个文件处理函数，自己学习下吧不是一句两句能说的清楚。这里的意思是将这一行的第五个字符块按照"%12.6f \n"这样的格式输出。这是printf指定的输出格式，google一下你就明白了
echo $i  $E >>comment          这里你的理解没错
done

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2楼2011-01-25 18:44:05

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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
Gina88(金币+10): 2011-01-26 19:56:58
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢详细指导 2011-01-27 10:00:12

可以用vi编辑器，编辑完当然要保存退出
保存退出后看下它的权限，如果不是可执行文件就“chmod +x 文件名”
文件名自己取，比如xxx.sh
运行时./xxx.sh就可以
cat >INCAR<不可以省略，如果没有这一符号相当于cat INCAR就是打印INCAR的内容
前面加#是注释，可以省略。第一行#!不一样，是指定shell类型，不是注释
不可以省略tail -1静态计算只有一行，驰豫会有N多行，最后一行是驰豫结束的结果
tail ,head 与more, less是不一样的，具体你可以百度一下这里用tail最合适

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6楼2011-01-26 11:49:40

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