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voleyes

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】用Amber做MD，怎样得到 B-factor ？

另外，从 B-factor 中能够了解到什么信息？
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1楼 2011-01-25 15:49:34
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zixi

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-02-05 20:51:11
通过轨道文件计算每个原子的位置涨落（RMSF），从RMSF利用公式 b-factor = 8*pi*pi* 得到温度因子。不过感觉这个方法做的效果不是很好，我算的要比pdb文件里面的b-factor大很多
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2楼2011-01-30 11:04:12
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