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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】CASTEP MPI 运行错误
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saikun

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】CASTEP MPI 运行错误

请问大家知道是什么问题吗？ castep运行serial job是没问题的，但运行mpi就产生错误:

/home/kk/local/Accelrys/MS55/bin/castepexe_mpi.exe: error while loading shared libraries
: libls_license64_g346.so: cannot open shared object file: No such file or directory
MPI Application rank 0 exited before MPI_Init() with status 127

"libls_license64_g346.so"   明明就在 ~/local/Accelrys/LicensePack/linux/lib

在~/share/bin/runMSserver.sh  加一行, echo $LD_LIBRARY_PATH (如下), 可见这文件夹也在$LD_LIBRARY_PATH上哦，干吗找不到哦?

#xx
echo $LD_LIBRARY_PATH
/home/kk/local/Accelrys/MS55/lib/5.8.9/x86_64-linux-thread-multi/CORE:/home/kk/local/Accelrys/LicensePack/linux/lib:/home/kk/local/Accelrys/MS55//lib:/home/kk/local/Accelrys/MS55//lib/32:/opt/intel/Compiler/11.1/059/lib/intel64:/opt/intel/Compiler/11.1/059/ipp/em64t/sharedlib:/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t:/opt/intel/Compiler/11.1/059/tbb/intel64/cc4.1.0_libc2.4_kernel2.6.16.21/lib:/opt/intel/Compiler/11.1/059/lib/intel64:/opt/intel/Compiler/11.1/059/ipp/em64t/sharedlib:/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t:/opt/intel/Compiler/11.1/059/tbb/intel64/cc4.1.0_libc2.4_kernel2.6.16.21/lib
#x
$MS_INSTALL_ROOT/bin/perl $DSD_ROOT/servers/$ser

（按，这错误不单是castep，其它模块也不能运行mpi）
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1楼 2011-01-21 15:38:34
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lbambool

木虫 (著名写手)
★ ★
saikun(金币+3):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 谢谢交流 2011-01-21 19:28:28
把ms_setup.sh -s bash改为 sh试试
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-01-21 19:14:00
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qnsyhanjiu

木虫 (著名写手)
★
saikun(金币+3):谢谢参与
我安装的是dmol模块，单机多核可以并行，但是多机并行，就出现和你一样的错误，你这个问题解决了吗？怎么解决的呀？
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3楼2011-06-13 22:27:38
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
★
saikun(金币+3):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by saikun at 2011-01-21 15:38:34:
请问大家知道是什么问题吗？ castep运行serial job是没问题的，但运行mpi就产生错误:

/home/kk/local/Accelrys/MS55/bin/castepexe_mpi.exe: error while loading shared libraries
: libls_license64_g346.s ...

我想问一下 你安装了mpi没有？
你的LD_LIBRARY_PATH里面没有mpi的库
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4楼2011-06-14 12:36:31
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vasp001

金虫 (正式写手)
★ ★
saikun(金币+3): 谢谢参与
fzx2008: 金币+1, 谢谢指教 2012-05-23 19:02:32
引用回帖:
506029楼: Originally posted by saikun at 2011-01-21 15:38:34:
请问大家知道是什么问题吗？ castep运行serial job是没问题的，但运行mpi就产生错误:

/home/kk/local/Accelrys/MS55/bin/castepexe_mpi.exe: error while loading shared libraries
: libls_license64_g346.so:

是这个库文件找不到，写一下环境变量，就ok了。


/Accelrys/LicensePack/linux/bin
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5楼2012-05-23 17:47:29
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vasp001

金虫 (正式写手)
★
saikun(金币+3): 谢谢参与
系统找不到这个库文件，需要在环境变量里声明一下啊。
/Accelrys/LicensePack/linux/bin

不好意思，我写错路径了，
在你的bashrc里面加入一行，就可以了。
export LD_LIBRARY_PATH=/export/home/binli/Accelrys/LicensePack/linux/lib:$LD_LIBRARY_PATH

就是告诉系统这个文件所在的路径，我安装的是MS 6.0 ，其目录为
/export/home/binli/Accelrys/LicensePack/linux/lib

目录下面有如下文件：
-rwxrwxr-x. 1 binli binli 2227376 Sep 27  2011 libls_license64_g346.so
-rwxrwxr-x. 1 binli binli 2145043 Sep 27  2011 libls_license64_g411.so
-rwxrwxr-x. 1 binli binli 2412981 Sep 27  2011 libls_license_g323.so
-rwxrwxr-x. 1 binli binli 2409844 Sep 27  2011 libls_license_g323s.so
-rwxrwxr-x. 1 binli binli 2380611 Sep 27  2011 libls_license_g346.so
-rwxrwxr-x. 1 binli binli 5056567 Sep 27  2011 libls_licenseRH7_01i7.so
-rwxrwxr-x. 1 binli binli 2123776 Sep 27  2011 libls_licenseRH7_g01.so
-rwxrwxr-x. 1 binli binli 2098394 Sep 27  2011 libls_licenseRH7_g01s.so

他们出现了这个问题，我用这个方法将问题解决了。
祝好。

[ Last edited by vasp001 on 2013-2-3 at 23:25 ]
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6楼2012-05-23 17:48:41
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vasp001

金虫 (正式写手)
★
saikun(金币+3): 谢谢参与
你好，请问问题解决了???？
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7楼2013-02-03 23:10:35
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