应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 【求助】运行q2r时候报错！
61/1返回列表
查看: 2292  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xijinyang

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】运行q2r时候报错！

我想计算graphene的电声相互作用量，在计算到第四步q2r.x（由倒空间的动力学矩阵元变为实空间的）报错，具体错误提示是：
     from init : error #         1
      nc already filled: wrong q grid or wrong nr

我的第一步较密k-mesh的scf的输入文件为：

&control
calculation = 'scf'
restart_mode='from_scratch'
wf_collect=.true.
outdir = './scf'
prefix = 'graphene'
pseudo_dir = './'
/
&system
ibrav = 4
celldm(1) = 4.65088, celldm(3)=3.0119
nat = 2
ntyp = 1
nbnd = 16
ecutwfc = 60
occupations = 'smearing'
degauss = 0.001
smearing = 'gaussian'
la2F = .true.
/
&electrons
conv_thr = 1.D-8
diagonalization = 'david'
/
ATOMIC_SPECIES
C 12.0107 C.pz-vbc.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
C  6.6666765924E-01  3.3333531848E-01  2.6727647101E-51
C  3.3333234076E-01  6.6666468152E-01 -2.6727647101E-51
K_POINTS {automatic}
72 72 1 0 0 0

第二步较疏k-mesh的scf输入文件为：
&control
calculation = 'scf'
restart_mode='from_scratch'
wf_collect=.true.
outdir = './scf'
prefix = 'graphene'
pseudo_dir = './'
/
&system
ibrav = 4
celldm(1) = 4.65088, celldm(3)=3.0119
nat = 2
ntyp = 1
nbnd = 16
ecutwfc = 60
occupations = 'smearing'
degauss = 0.001
smearing = 'gaussian'
/
&electrons
conv_thr = 1.D-8
diagonalization = 'david'
/
ATOMIC_SPECIES
C 12.0107 C.pz-vbc.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
C  6.6666765924E-01  3.3333531848E-01  2.6727647101E-51
C  3.3333234076E-01  6.6666468152E-01 -2.6727647101E-51
K_POINTS {automatic}
36 36 1 0 0 0

第三步较疏q-mesh的ph.x的输入文件为：

Electron-phonon coefficients for graphene
&inputph
recover = .true.  
tr2_ph=1.0d-14
prefix='graphene'
fildvscf='graphene_dv'
amass(1)=12.0107
outdir='./scf'
fildyn='graphene.dyn'
elph=.true.
trans=.true.
ldisp=.true.
nq1=24, nq2=24, nq3=1
/

第四步q2r.x的输入文件为：
&input
zasr='simple',
fildyn='graphene.dyn',
flfrc='graphene.fc',
la2F=.true.
/

难道是我q-mesh取得有问题？请大家指教！谢谢！
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

qingeraaa

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-01-20 09:11:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qingeraaa

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
刚开始用Qe，有看到说q点数目需要整除K点网格  楼主的问题如何解决的？
赞一下 回复此楼
2楼2013-11-21 19:42:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
LZ的错误可能是和la2F有关的，虽然在说明中没有写，而且好象PWgui中也没有，不过若是要做el-ph的话，在SCF时，system namelist下也有个类似la2F的参数的，这里没有就会在后面的q2r.x处挂点~
具体的参数可以参考官方给出的la2F的算例。
赞一下 回复此楼
3楼2013-11-30 20:00:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
也许我的经历可以帮帮你。将所有的a2Fq2r.*文件全部删掉，然后再算。这个文件有记忆性，它只保存你第一次计算的网格值，后面的计算跟第一次不一样就会报错。这个问题我跟paolo反映了，他不理我，我也只有在小木虫上提醒大家了。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2013-12-19 10:56:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiangzhe123

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，我最近在运行q2r时候，出现了你这相同的错误，你这问题后来是怎么解决的啊？能指教一下吗？
赞一下 回复此楼
5楼2015-01-27 19:12:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

湘粤cxy

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by gemucai at 2013-12-18 23:56:55
也许我的经历可以帮帮你。将所有的a2Fq2r.*文件全部删掉，然后再算。这个文件有记忆性，它只保存你第一次计算的网格值，后面的计算跟第一次不一样就会报错。这个问题我跟paolo反映了，他不理我，我也只有在小木虫上 ...

把a2Fq2r.*全删掉也还是会出问题呀
赞一下 回复此楼
6楼2021-10-11 16:22:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 学员UKbkc5 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭