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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【讨论】奇怪的分子轨道图
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ZJboy

木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】奇怪的分子轨道图已有9人参与

各位有没有试过用GV读取formchk文件作分子轨道图时，有时得到一些很奇怪的图的现象？如果有的话，不妨讨论一下。还是说，各位总是能得到合理的分子轨道图？

[ Last edited by zhou2009 on 2011-1-15 at 09:10 ]
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1楼2011-01-14 23:30:42
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zhou2009

版主 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请贴出很奇怪的图来分析
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2楼2011-01-15 09:14:22
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minisun

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
怎么个奇怪法？贴张图出来看看
占有轨道一般不会，你说的是空轨道吧？
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每天心平气和、健健康康的活着就是幸福！
3楼2011-01-24 19:57:49
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ZJboy

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by minisun at 2011-01-24 19:57:49:
怎么个奇怪法？贴张图出来看看
占有轨道一般不会，你说的是空轨道吧？

LUMO
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4楼2011-01-25 15:24:32
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zhou2009

版主 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
LUMO因为常是反键轨道，分子轨道图不是向键中间聚集，而是向键外有巨大的反向延伸，极其弥散，图形极大看不到边，应不奇怪。
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5楼2011-01-25 18:39:01
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yuhuobuku

木虫 (正式写手)
★
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引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-01-25 18:39:01:
LUMO因为常是反键轨道，分子轨道图不是向键中间聚集，而是向键外有巨大的反向延伸，极其弥散，图形极大看不到边，应不奇怪。

调整系数试试呢？
很久没来小木虫了。吼吼
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薄酒可以忘忧，丑妻可以白头，徐行不必驷马，称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
6楼2011-01-25 19:03:53
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jimuwei

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我使用chemoffice链接gauss03进行计算的时候有时候会出来一些很怪异的轨道图。

特别是计算大共轭体系的时候。
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Signalflag
7楼2011-01-25 22:13:50
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zhou2009

版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+10): 2011-01-30 10:54:39
GV总是一是一、二是二忠实于于你提供的计算结果数据的。
GV有时得到一些很奇怪的图的现象，所谓很奇怪的图无非是出乎自己意料。
它表明了两种可能：
一种可能是在什么地方有失误，包含GV运用上的失误。有时我作密度差时，得到的结果完全出乎意料，经过仔细查找，总能找到失误所在，改过来就好了。
另一种可能是，这种图形出乎意料，提供了意料之外的信息，我们必须重新认识它、解析它，是新知的起点，从而有所发现、有所前进。
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8楼2011-01-26 10:08:04
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ZJboy

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by jimuwei at 2011-01-25 22:13:50:
我使用chemoffice链接gauss03进行计算的时候有时候会出来一些很怪异的轨道图。

特别是计算大共轭体系的时候。

那您有没有研究过原因？
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9楼2011-01-26 11:35:52
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zhou2009

版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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yjcmwgk(金币+10): 2011-01-30 10:55:25
当然，上面只是从MO或者ρ说的，你计算出什么cube，GV就给你忠实地画出来。

但是对于用球-键来表示分子的成键键型时，GV只从原子距离来判断，对于恰好处在某种键长范畴边缘时，对键的有无可能出现失误。
特别是由于没有考虑电子数目，可能对芳环判断、表达失误。
如对于卟吩，其中相对的两个吡咯环N上带H，有6个电子共轭是芳环。另外相对的两个吡咯环N上不带H，只有5个电子共轭不是芳环。当指定用球-键型（Ball & Bond Type）来表示时，GV会根据原子距离来判断，画出卟吩中4个吡咯环是等同的芳环。要特别小心，作图时需要手动操作改正过来。
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10楼2011-01-27 09:20:07
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