24小时热门版块排行榜    

查看: 3043  |  回复: 31

ZJboy

木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】奇怪的分子轨道图 已有9人参与

各位有没有试过用GV读取formchk文件作分子轨道图时,有时得到一些很奇怪的图的现象?如果有的话,不妨讨论一下。还是说,各位总是能得到合理的分子轨道图?

[ Last edited by zhou2009 on 2011-1-15 at 09:10 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

量子化学和计算化学

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
请贴出很奇怪的图来分析
2楼2011-01-15 09:14:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

minisun

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
怎么个奇怪法?贴张图出来看看
占有轨道一般不会,你说的是空轨道吧?
每天心平气和、健健康康的活着就是幸福!
3楼2011-01-24 19:57:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by minisun at 2011-01-24 19:57:49:
怎么个奇怪法?贴张图出来看看
占有轨道一般不会,你说的是空轨道吧?

LUMO
4楼2011-01-25 15:24:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
LUMO因为常是反键轨道,分子轨道图不是向键中间聚集,而是向键外有巨大的反向延伸,极其弥散,图形极大看不到边,应不奇怪。
5楼2011-01-25 18:39:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuhuobuku

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-01-25 18:39:01:
LUMO因为常是反键轨道,分子轨道图不是向键中间聚集,而是向键外有巨大的反向延伸,极其弥散,图形极大看不到边,应不奇怪。

调整系数试试呢?
很久没来小木虫了。吼吼
薄酒可以忘忧,丑妻可以白头,徐行不必驷马,称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
6楼2011-01-25 19:03:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jimuwei

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我使用chemoffice链接gauss03进行计算的时候有时候会出来一些很怪异的轨道图。

特别是计算大共轭体系的时候。
Signalflag
7楼2011-01-25 22:13:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+10): 2011-01-30 10:54:39
GV总是一是一、二是二忠实于于你提供的计算结果数据的。
GV有时得到一些很奇怪的图的现象,所谓很奇怪的图无非是出乎自己意料。
它表明了两种可能:
一种可能是在什么地方有失误,包含GV运用上的失误。有时我作密度差时,得到的结果完全出乎意料,经过仔细查找,总能找到失误所在,改过来就好了。
另一种可能是,这种图形出乎意料,提供了意料之外的信息,我们必须重新认识它、解析它,是新知的起点,从而有所发现、有所前进。
8楼2011-01-26 10:08:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by jimuwei at 2011-01-25 22:13:50:
我使用chemoffice链接gauss03进行计算的时候有时候会出来一些很怪异的轨道图。

特别是计算大共轭体系的时候。

那您有没有研究过原因?
9楼2011-01-26 11:35:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+10): 2011-01-30 10:55:25
当然,上面只是从MO或者ρ说的,你计算出什么cube,GV就给你忠实地画出来。

但是对于用球-键来表示分子的成键键型时,GV只从原子距离来判断,对于恰好处在某种键长范畴边缘时,对键的有无可能出现失误。
特别是由于没有考虑电子数目,可能对芳环判断、表达失误。
如对于卟吩,其中相对的两个吡咯环N上带H,有6个电子共轭是芳环。另外相对的两个吡咯环N上不带H,只有5个电子共轭不是芳环。当指定用球-键型(Ball & Bond Type)来表示时,GV会根据原子距离来判断,画出卟吩中4个吡咯环是等同的芳环。要特别小心,作图时需要手动操作改正过来。
10楼2011-01-27 09:20:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ZJboy 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-30 11:07 by l0VvVHGBGRLv
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 08:33 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:28 by ZPa0EcMwuECS
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 06:35 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:58 by ZPa0EcMwuECS
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 01:14 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +5 德尚中行 2026-08-27 6/300 2026-08-29 18:10 by manplx
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +9 苏东坡二世 2026-08-23 9/450 2026-08-29 14:41 by hustersqt
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见