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ZJboy

木虫 (著名写手)

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[交流] 【讨论】奇怪的分子轨道图已有9人参与

各位有没有试过用GV读取formchk文件作分子轨道图时，有时得到一些很奇怪的图的现象？如果有的话，不妨讨论一下。还是说，各位总是能得到合理的分子轨道图？

[ Last edited by zhou2009 on 2011-1-15 at 09:10 ]

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1楼 2011-01-14 23:30:42

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zhou2009

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+10): 2011-01-30 10:55:25

当然，上面只是从MO或者ρ说的，你计算出什么cube，GV就给你忠实地画出来。

但是对于用球-键来表示分子的成键键型时，GV只从原子距离来判断，对于恰好处在某种键长范畴边缘时，对键的有无可能出现失误。
特别是由于没有考虑电子数目，可能对芳环判断、表达失误。
如对于卟吩，其中相对的两个吡咯环N上带H，有6个电子共轭是芳环。另外相对的两个吡咯环N上不带H，只有5个电子共轭不是芳环。当指定用球-键型（Ball & Bond Type）来表示时，GV会根据原子距离来判断，画出卟吩中4个吡咯环是等同的芳环。要特别小心，作图时需要手动操作改正过来。