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【求助】限制一起被复制了吗?
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5858797
木虫
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[交流]
【求助】限制一起被复制了吗?
MS 中Discover模块,我对其中一部分分子做了限制 ,constraint,在哪个文件中可以看到 限制于不限制的区别,?因为预平衡时,我对部分原子做了限制,在之后的平衡时,我把预平衡中的分子和box 全部Alt+ctrl 选中,在进行预平衡时,发现之前的限制的部分分子还是限制的,怎么消除之前的限制呢?谢谢 大侠
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2011-01-13 12:29:22
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hh19850402
木虫
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★
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流,一般都用xsd计算吧 2011-02-19 11:04:22
引用回帖:
Originally posted by
5858797
at 2011-01-15 02:06:41:
在前一步的基础上做?前一步得到的是轨迹文件,下一步应该在xsd格式下再重新开始吧?是吗
轨迹文件也可以进行计算
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7楼
2011-02-19 10:12:22
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sikasun
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★
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2011-01-13 14:56:20
5858797(金币+2): 2011-01-14 13:17:37
5858797(金币+1):有帮助 2011-01-14 13:21:17
modify-constraints
把限制取消就行
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2楼
2011-01-13 12:57:24
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5858797
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Originally posted by
sikasun
at 2011-01-13 12:57:24:
modify-constraints
把限制取消就行
下一步的初始构象是怎么弄的,是在前一步的基础上 全选,连同box也复制下来吗?要是不复制下来box,只把分子复制下来,再重新建box,会有很多分子连起来,怎么办好呢,因为我全部选下来之后,用这个跑平衡,出现了分子不是做无规律的热运动,好像被限制了一样,所以的分子都在做摇摆运动。
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3楼
2011-01-14 13:20:56
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sikasun
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★
sunyang1988(金币+1):歇歇交流 2011-01-14 16:58:21
在前一步的基础上做就可以了,为什么要复制呢
引用回帖:
Originally posted by
5858797
at 2011-01-14 13:20:56:
下一步的初始构象是怎么弄的,是在前一步的基础上 全选,连同box也复制下来吗?要是不复制下来box,只把分子复制下来,再重新建box,会有很多分子连起来,怎么办好呢,因为我全部选下来之后,用这个跑平衡,出现 ...
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4楼
2011-01-14 15:53:49
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