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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】限制一起被复制了吗？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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5858797

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】限制一起被复制了吗？

MS 中Discover模块，我对其中一部分分子做了限制 ，constraint，在哪个文件中可以看到 限制于不限制的区别，？因为预平衡时，我对部分原子做了限制，在之后的平衡时，我把预平衡中的分子和box 全部Alt+ctrl 选中，在进行预平衡时，发现之前的限制的部分分子还是限制的，怎么消除之前的限制呢？谢谢 大侠
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1楼 2011-01-13 12:29:22
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5858797

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by sikasun at 2011-01-13 12:57:24:
modify-constraints
把限制取消就行

下一步的初始构象是怎么弄的，是在前一步的基础上 全选，连同box也复制下来吗？要是不复制下来box,只把分子复制下来，再重新建box，会有很多分子连起来，怎么办好呢，因为我全部选下来之后，用这个跑平衡，出现了分子不是做无规律的热运动，好像被限制了一样，所以的分子都在做摇摆运动。
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3楼2011-01-14 13:20:56
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sikasun

木虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2011-01-13 14:56:20
5858797(金币+2): 2011-01-14 13:17:37
5858797(金币+1):有帮助 2011-01-14 13:21:17
modify-constraints
把限制取消就行
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2楼2011-01-13 12:57:24
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sikasun

木虫 (正式写手)
★
sunyang1988(金币+1):歇歇交流 2011-01-14 16:58:21
在前一步的基础上做就可以了，为什么要复制呢
引用回帖:
Originally posted by 5858797 at 2011-01-14 13:20:56:

下一步的初始构象是怎么弄的，是在前一步的基础上 全选，连同box也复制下来吗？要是不复制下来box,只把分子复制下来，再重新建box，会有很多分子连起来，怎么办好呢，因为我全部选下来之后，用这个跑平衡，出现 ...

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4楼2011-01-14 15:53:49
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5858797

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by sikasun at 2011-01-14 15:53:49:
在前一步的基础上做就可以了，为什么要复制呢


在前一步的基础上做？前一步得到的是轨迹文件，下一步应该在xsd格式下再重新开始吧？是吗
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5楼2011-01-15 10:06:41
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