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zh104

铁虫 (初入文坛)


[交流] 【求助】投稿ACTA,一问题解决不了,求解答~~~

1. Your molecule contains NO anomalous scatterers, i.e. atoms with Z>13.
So you can not refine the Flack parameter. Moreover, you have to average the
Friedel pairs and refine your crystal structure a few cycles more.
You should mention it in Experimental section.

As example:

_publ_section_exptl_refinement
;
...
Due to the absence of any significant
anomalous scatterers in the molecule, the ???? ( - how many ?) Friedel pairs
were merged before the final refinement.
;

[ Last edited by wsht212 on 2011-1-13 at 15:00 ]
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)



wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2011-01-13 15:01:40
zh104(金币+1): 谢谢 2011-01-20 00:53:34
zh104(金币+1): 2011-01-20 13:45:03
很明显 你的 Z值是不合适的,要求你重新精修你的结构
2楼2011-01-13 13:05:02
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wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2011-01-13 15:01:59
反常散射 是不是merg2 or3精修
3楼2011-01-13 13:36:09
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andyzhu

木虫 (正式写手)



wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2011-01-13 15:02:19
引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2011-01-13 13:36:09:
反常散射 是不是merg2 or3精修

XI2004老师讲过的,merg 2 和merg 3的数值相减。见XI2004老师的帖子啊。
4楼2011-01-13 14:35:03
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wsht212: 谢谢交流,希望常来! 2011-01-20 19:19:32
引用回帖:
Originally posted by andyzhu at 2011-01-13 14:35:03:



XI2004老师讲过的,merg 2 和merg 3的数值相减。见XI2004老师的帖子啊。

编辑的意思是不是不需要合并了?
5楼2011-01-13 15:10:34
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lilywang501

金虫 (小有名气)



wsht212(金币+1): 谢谢交流,希望常来! 2011-01-20 19:19:25
要拼合Friedel pairs ,而且要在cif中将拼合的个数写进去
6楼2011-01-13 19:25:37
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zh104

铁虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by andyzhu at 2011-01-13 14:35:03:



XI2004老师讲过的,merg 2 和merg 3的数值相减。见XI2004老师的帖子啊。

我找了半天没找到XI2004老师的帖子,知情虫友帮帮忙,谢谢~
7楼2011-01-20 14:09:19
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zh104

铁虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by andyzhu at 2011-01-13 14:35:03:



XI2004老师讲过的,merg 2 和merg 3的数值相减。见XI2004老师的帖子啊。

具体怎么操作,谢谢
8楼2011-01-20 14:17:53
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wsht212(金币+3): 谢谢交流,希望常来! 2011-01-20 19:20:09
wsht212(金币+1, CMEI+1): 谢谢老师指点 2011-01-20 19:20:27
非也。
他的意思是你的结构中没有原子序大于13的“重”原子,所以,没有足够的反常散射来协助确定绝对构型,所以,不能修正flack参数。

具体处理是:
在.ins中,加merg 3
然后精修,
然后在CIF文件中删除有关flack参数的两行
即删除以下两行:
_refine_ls_abs_structure_details
'Flack H D (1983), Acta Cryst. A39, 876-881'
_refine_ls_abs_structure_Flack    0.10(9)

同时在CIF中加上

chemical_absolute_configuration unk
一般可加在空间群的那两行后。


并且如一楼编辑所说,在CIF中加上:

_publ_section_exptl_refinement
;
...
Due to the absence of any significant
anomalous scatterers in the molecule, the ???? ( - how many ?) Friedel pairs
were merged before the final refinement.
;



至于如何知道Friedel pairs的数目, 参见我以前的帖, 或者搜一下。
9楼2011-01-20 14:58:19
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wsht212(金币+1): 谢谢交流,希望常来! 2011-01-20 19:21:18
10楼2011-01-20 15:00:01
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lanmao20

金虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wsht212: 谢谢交流,希望常来! 2011-01-22 16:22:42
老师正解。。。。。。。本来粘贴下来想解惑一下,看来还是老师迅速啊。。。致敬!
11楼2011-01-20 22:57:43
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zh104

铁虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2011-01-20 14:58:19:
非也。
他的意思是你的结构中没有原子序大于13的“重”原子,所以,没有足够的反常散射来协助确定绝对构型,所以,不能修正flack参数。

具体处理是:
在.ins中,加merg 3
然后精修,
然后在CIF文件中删除有 ...

谢谢老师的指点!
12楼2011-01-21 12:33:02
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