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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】有关配位水上氢的温度因子
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倚门回首

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】有关配位水上氢的温度因子

我的配位水上的氢都是从Q峰中找到的
他们的键长
O4 -        Distance       Angles
Cu1       1.9911 (0.0040)
H4B2      0.8634 (0.0885)  104.88 (5.36)
H4B1      0.8686 (0.1035)  108.47 (6.43)  98.08 (7.69)
               O4 -          Cu1           H4B2         
在lst文件中为

O4    5   0.55046   0.43958   0.25740  11.00000   0.02147   0.02401 =
        0.02092  -0.00043   0.00828  -0.00217
H4B2  6   0.53210   0.39060   0.18030  11.00000   0.05000
H4B1  6   0.46420   0.48190   0.18370  11.00000   0.05000
我想问一下：
在'_publ_section_exptl_refinement' 部分要写温度因子Uiso该怎么样写呢？
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1楼 2011-01-08 08:43:41
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zhonggao18

荣誉版主 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 倚门回首 at 2011-01-08 10:26:29:

谢谢你！
我想问一下，
dfix 0.85 0.01 O H1  O H2
dfix  1.39 0.02 H1 H2
是在WGHT前面输入吗？
我这样做了原来的O-H键的键长变为
O4 -        Distance       Angles
Cu1       1.9906 (0.0039)
  ...

把氢的温度因子应该为-1.5
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4楼2011-01-18 15:13:01
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244073931

至尊木虫 (著名写手)
倚门回首(金币+5): 2011-01-08 10:21:46
从Q找到H后还要限制O-H 和H-Hj距离，如dfix 0.85 0.01 O H1  O H2
dfix  1.39 0.02 H1 H2，然后精修。此时H有自己的温度因子。如果按你上面的也可以再用afix  3  ，设置1.5Uiso（O）  随后再精修。
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2楼2011-01-08 09:28:52
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倚门回首

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 244073931 at 2011-01-08 09:28:52:
从Q找到H后还要限制O-H 和H-Hj距离，如dfix 0.85 0.01 O H1  O H2
dfix  1.39 0.02 H1 H2，然后精修。此时H有自己的温度因子。如果按你上面的也可以再用afix  3  ，设置1.5Uiso（O）  随后再精修。

谢谢你！
我想问一下，
dfix 0.85 0.01 O H1  O H2
dfix  1.39 0.02 H1 H2
是在WGHT前面输入吗？
我这样做了原来的O-H键的键长变为
O4 -        Distance       Angles
Cu1       1.9906 (0.0039)
H4B1      0.8400           109.47      
H4B2      0.9773           109.39         76.53      
               O4 -          Cu1           H4B1         
似乎不合理了，而且H4B2太长了。
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3楼2011-01-08 10:26:29
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