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【求助】GaussView 中怎么调堆积聚集体的结构
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最近优化一个堆积聚集体结构，总是得不到理想的结果。要求是：两个分子必须是面对面的排列，并且之间的距离为3.9A。。主要问题是两个分子之间3.9的距离没法调，不知道以什么为基准，另一个是两个分子之间的相对距离要怎么调，是DCN是放进一些还是放出一些。 请教各位高手指点。 以下是我调的结构： tdcn1 0 1 C 0.00000000 0.00000000 0.00000000 C 0.00000000 0.00000000 1.39950137 C 1.21181222 0.00000000 2.09929115 C 2.42102177 0.00206532 1.39247163 C 2.42026876 0.00006885 -0.00589602 C 1.20831677 -0.00299830 -0.71437163 C 1.41940724 -1.51192641 -2.79188182 C 1.18700998 -0.06836541 -2.23652097 C 2.73853599 -1.37957103 -3.54058825 N 3.17224372 -0.14738898 -3.57344074 N 2.30683818 0.67758732 -2.87559474 C 2.44399016 2.07033293 -2.93286504 C 3.50211922 2.65397123 -3.66168067 C 1.52110577 2.90640041 -2.27213537 C 3.62384364 4.04147743 -3.72161517 C 1.65896735 4.29550465 -2.34647792 C 2.70617252 4.87597054 -3.06852207 C 3.45659575 -2.47997329 -4.17613442 C 4.68668199 -2.25835222 -4.83516097 C 2.93426991 -3.78898645 -4.14833346 C 5.36390948 -3.31256317 -5.44421550 C 4.83411757 -4.61148073 -5.41140710 C 3.61771410 -4.84335139 -4.76142782 H -0.94375729 0.00564632 -0.53998807 H -0.94161146 0.00582153 1.93965625 H 1.21467147 0.00452413 3.18461251 H 3.36414573 0.00993724 1.92977497 H 3.35715728 0.01743262 -0.55322451 H 0.61297167 -1.82608441 -3.46587584 H 1.47358667 -2.24352739 -1.97964387 H 0.23397996 0.33651095 -2.59810588 H 4.20534073 2.00910999 -4.17114502 H 0.71335433 2.48099918 -1.68985870 H 4.44309518 4.47467714 -4.28767969 H 0.93967530 4.92410591 -1.83020688 H 2.80748064 5.95477627 -3.12134048 H 5.09278059 -1.25372395 -4.85656831 H 1.99196514 -3.98555452 -3.64728307 H 6.30813725 -3.12509200 -5.94603072 H 5.36519970 -5.43030516 -5.88607696 H 3.19949978 -5.84460473 -4.72979422 N 1.83889071 4.39688968 -6.42928130 C 2.14668401 1.88083851 -7.03087649 C 3.34393624 1.45162299 -7.59370895 C 3.53209102 0.09752610 -7.92652506 C 2.52371336 -0.83269722 -7.69781264 C 1.08006471 0.95161110 -6.77856086 C 1.27202256 -0.43006121 -7.11814309 C -0.15713781 1.35468960 -6.20463179 C -1.15955916 0.43386305 -5.97652923 C -0.96997283 -0.93051115 -6.31187275 C 0.21918464 -1.35341689 -6.87025261 C 1.98016003 3.26308442 -6.70141014 C 2.73947783 -2.20377926 -8.04495416 N 2.91168073 -3.33056861 -8.32818631 H 4.13780941 2.16577233 -7.77722472 H 4.46974396 -0.22338261 -8.36442449 H -0.30157247 2.39857491 -5.94830835 H -2.09877027 0.75355153 -5.53823514 H -1.76564027 -1.64420092 -6.12754837 H 0.36493005 -2.39700150 -7.12704588 |
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