| 查看: 1262 | 回复: 1 | |||
[交流]
【求助】ubuntu phonopy
|
|
有没有使用phonopy的朋友?我在ubuntu上装了phonopy,开始运行正常,后来算另一个时(原子种类由2种变成4种)出现一下问题:运行phonopy产生超胞,phonopy -f vasprun.mxl-*产生FORCES都正常,最后执行phonopy -p时出现一下: Band structure mode Settings: Supercell: [3 3 1] Spacegroup: P2_1/m (11) Traceback (most recent call last): File "/usr/local/bin/phonopy", line 505, in forces = file_IO.parse_FORCES( supercell ) File "/home/dxp/phonopy-0.9.3/lib/python/phonopy/file_IO.py", line 29, in parse_FORCES forces = Forces( atom_number-1, displacement, forces_tmp ) File "/home/dxp/phonopy-0.9.3/lib/python/phonopy/forces.py", line 17, in __init__ self.forces = np.array(forces) ValueError: setting an array element with a sequence. 请问大家知不知道什么原因? 还有在算另一个时出现一下情况: Supercell: [3 3 1] Spacegroup: P6_3/mmc (194) Paths in reciprocal reduced coordinates: [ 0.00 0.00 0.00] --> [ 0.00 0.00 0.50] [ 0.00 0.00 0.50] --> [-0.33 0.67 0.50] [-0.33 0.67 0.50] --> [-0.33 0.67 -0.00] [-0.33 0.67 0.00] --> [ 0.00 -0.00 0.00] [ 0.00 0.00 0.00] --> [ 0.00 0.50 0.00] [ 0.00 0.50 0.00] --> [ 0.00 0.50 0.50] [ 0.00 0.50 0.50] --> [-0.33 0.67 0.50] Traceback (most recent call last): File "/usr/local/bin/phonopy", line 583, in is_eigenvectors=settings.get_is_eigenvectors() ) File "/home/dxp/phonopy-0.9.3/lib/python/phonopy/__init__.py", line 284, in set_band_structure factor=self.factor ) File "/home/dxp/phonopy-0.9.3/lib/python/phonopy/band_structure.py", line 20, in __init__ self.set_band( verbose=verbose ) File "/home/dxp/phonopy-0.9.3/lib/python/phonopy/band_structure.py", line 72, in set_band eigvals.append(np.linalg.eigvalsh(dm).real) File "/usr/lib/python2.6/dist-packages/numpy/linalg/linalg.py", line 722, in eigvalsh raise LinAlgError, 'Eigenvalues did not converge' numpy.linalg.linalg.LinAlgError: Eigenvalues did not converge 这又是怎么回事? 有时出现上面情况,有计算成功的时候。 |
» 猜你喜欢
航天502所 高瑛珂博士 婚内征婚 欺骗女性开房
已经有26人回复
26/27申博
已经有4人回复
地球科学部D01口青年基金,最低几A几B几C才能有几率中呀。
已经有4人回复
博士申请
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
编译 fropho
已经有8人回复
求phononpy或frophon安装包
已经有14人回复
scipy 编译错误
已经有3人回复
【求助】Phonopy 计算声子频率的问题
已经有9人回复
【求助】算声子谱的时候LO-TO谱出错(vasp+fropho)
已经有8人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
急招:深大26级博士招生-光机电工程与应用专业
+5/915
清华大学深圳国际研究生院周栋课题组博士研究生招聘
+1/178
温州医科大学沈建良课题组招聘2026级博士生
+1/100
浙江大学医学院附属妇产科医院张霈婧课题组招科研助理——生物信息方向
+2/98
测试█TEM/ EPR/ XPS/PY-GCMS/TG-IR/XRF/BET/MIP/核磁/EA/ICP,VX: 761711562。
+1/86
【通知】北京信息科技大学仪器科学与光电工程学院招收博士研究生(2026)
+1/82
Polymers期刊特刊Polymeric Materials for Advanced Drug Delivery组稿
+1/75
面上祈福
+1/67
湖北工业大学荧光检测与新药创制团队招收博士研究生 2026年9月份入学博士生/博士后
+1/50
西工大国家级青年人才招聘微尺度传热方向博士后/研究助理
+1/32
【通知】北京信息科技大学仪器科学与光电工程学院招收博士研究生(2026),还有名额!
+1/28
博士申请
+1/20
【通知】北京信息科技大学仪器科学与光电工程学院招收博士研究生(2026)
+2/16
“双一流”南京邮电大学--海优团队--招收2026博士生1-2名(6月15日前有效)
+1/10
同济大学环境学院 肖倩研究员课题组 招聘2027级硕士/博士
+1/4
北理工国家杰青团队招博士后
+1/2
哈尔滨工业大学/院士团队招收 硕士、博士
+1/2
储能与电子材料课题组 招收硕士 or 博士研究生——以色列理工-GTIIT联培
+1/1
深圳大学材料学院“智能分子材料团队”招聘博士后(连续流微反应器方向优先)
+1/1
【博士招生】武汉科技大学招收材料、化工、环境、冶金类2026年“申请-考核”制博士生
+1/1
2楼2016-08-23 15:42:07











回复此楼