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dagonghong

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】towhee_template 已有1人参与

我知道一个离子液体的分子的坐标,想用towhee_template做输入文件。大家能不能帮忙看一下towhee_template的格式呢?说明书中没有怎么介绍,我在example中看到compass_methanol中有一个,格式如下:
methanol for compass from david at accelrys
3.885679583    0.656627250   -8.424467283 c4o     C   0.001
3.825948769    1.695271615   -8.074693836 h1      H   0.053
3.365162009    0.582682775   -9.394534597 h1      H   0.053
3.379610623    0.008917560   -7.688418725 h1      H   0.053
5.260310973    0.337051867   -8.543473123 o2h     O  -0.580
5.306500476   -0.563325617   -8.846176523 h1o     H   0.420
我照着写了一个,前三列为坐标,第四列为在力场中的名字,第五列为元素名称,第六列为电荷。
但是总说格式错误。

后来我觉得应该和towhee_coords文件格式相同,就将分子坐标写成xyz文件,并用utils中fortran程序转化,该程序并没有直接转化为towhee_coords文件,而是转化成可一系列的坐标文件. 这些文件只是给出了转化后的坐标。请问怎么才能得到towhee_coords文件中除了三列坐标外,其他的后两列的东西呢?
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zyj8119

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by dagonghong at 2010-12-17 11:39:53:
我知道一个离子液体的分子的坐标,想用towhee_template做输入文件。大家能不能帮忙看一下towhee_template的格式呢?说明书中没有怎么介绍,我在example中看到compass_methanol中有一个,格式如下:
methanol for ...

帮顶下,希望towhee高手帮忙看看。
好好学习,天天向上。
2楼2010-12-17 14:27:12
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