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dagonghong新虫 (小有名气)
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【求助】towhee_template 已有1人参与
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我知道一个离子液体的分子的坐标，想用towhee_template做输入文件。大家能不能帮忙看一下towhee_template的格式呢？说明书中没有怎么介绍，我在example中看到compass_methanol中有一个，格式如下： methanol for compass from david at accelrys 3.885679583 0.656627250 -8.424467283 c4o C 0.001 3.825948769 1.695271615 -8.074693836 h1 H 0.053 3.365162009 0.582682775 -9.394534597 h1 H 0.053 3.379610623 0.008917560 -7.688418725 h1 H 0.053 5.260310973 0.337051867 -8.543473123 o2h O -0.580 5.306500476 -0.563325617 -8.846176523 h1o H 0.420 我照着写了一个，前三列为坐标，第四列为在力场中的名字，第五列为元素名称，第六列为电荷。 但是总说格式错误。 后来我觉得应该和towhee_coords文件格式相同，就将分子坐标写成xyz文件，并用utils中fortran程序转化，该程序并没有直接转化为towhee_coords文件，而是转化成可一系列的坐标文件. 这些文件只是给出了转化后的坐标。请问怎么才能得到towhee_coords文件中除了三列坐标外，其他的后两列的东西呢？ |
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2楼2010-12-17 14:27:12