| 查看: 4565 | 回复: 22 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
46437772木虫 (小有名气)
|
[交流]
【原创】如何利用KEGG定位基因属于哪个代谢通路 已有14人参与
|
||
|
有一些基因，打算确定他们分别和哪些代谢通路相关，想从KEGG里定位，请问有高手知道如何实现么？ 我把我摸索的提供一下，可能看起来很简单，但是对于从来不知道的（比如以前的我）朋友，找起来可能有点小麻烦  以Human的个别基因为例！ 首先打开网址：http://www.genome.jp/kegg/tool/color_pathway.html，  图中标示了红色1，2，3，为我们操作的地方！ 其中，1是下拉菜单，选择感兴趣的物种，默认是Reference Pathway，我选择Homo sapiens(Human)为例；2是输入感兴趣基因的地方，当然修改好格式的文档也可以直接上传，文本文档可以支持，其他的没试过。3是执行按钮。 此处，需要说明一下：fgcolor为前景颜色（个人理解），默认即可，无需关注；bgcolor为背景颜色，将来会在代谢通路中以此颜色突出显示你关注的基因，所以建议设置一下，我的示例数据如下图：  点击第一张图中的3，即Exec，应该出来下面的结果：  下面各位就可以点击相关的pathway看看你的基因位置啦 发这样的帖子挺费劲儿啊，第一次还搞错了，图片又重新上传编辑的！ 所以在此对曾经发帖的朋友表示一下敬佩和感谢！ 希望和感兴趣的朋友多多交流！ [ Last edited by 46437772 on 2010-12-15 at 22:01 ] |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
fengxiao01» 猜你喜欢
湖北师范大学招调剂啦
已经有9人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有197人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
化工申博
已经有3人回复
-
申博自荐
已经有3人回复
-
广西民族大学化学化工学院化学工程与技术学硕，材料化工专硕调剂名额充足！
已经有0人回复
fengxiao01
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 11275.8
- 红花: 2
- 帖子: 494
- 在线: 134.2小时
- 虫号: 1358923
- 注册: 2011-08-02
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
16楼2012-07-19 15:55:47
scelab
荣誉版主 (文坛精英)
小木虫之有关部门负责人
- 应助: 63 (初中生)
- 贵宾: 1.475
- 金币: 8294.6
- 散金: 4158
- 红花: 39
- 沙发: 99
- 帖子: 21277
- 在线: 3169.3小时
- 虫号: 482065
- 注册: 2007-12-20
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
- 管辖: 微生物
2楼2010-12-15 16:04:11
46437772
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2000.9
- 帖子: 211
- 在线: 52.3小时
- 虫号: 577528
- 注册: 2008-06-27
- 性别: GG
- 专业: MB&BC
3楼2010-12-15 16:17:53
46437772
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2000.9
- 帖子: 211
- 在线: 52.3小时
- 虫号: 577528
- 注册: 2008-06-27
- 性别: GG
- 专业: MB&BC
搞了半天还是沉了 唉。。。 4楼2010-12-15 22:02:26