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wangdandelia

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】质粒片段丢失问题 已有6人参与

各位虫友,我想请教一下,你们有没有遇到质粒转到感受态细胞后,会丢失片段的问题?
我最近遇到了一个问题,就是将质粒切开,人工插入一个片段,再连接后,转化到感受态细胞中,结果得到的新的质粒丢失了一个很大的片段,不知道这是什么原因,欢迎各位虫友来讨论一下!我用的是一个含有转座子的自杀质粒,pRL27。但是在受体菌中是可以稳定存在的。
我查找资料,至今还没有找到相关的原因。可能是感受态细胞出了问题,现在正准备把原质粒的菌体通过没有抗性的LB培养基传代培养,从而筛选一个完全丢失质粒的受体菌,不知道这个方法可行不可行,需要注意什么问题。



我做个对照试验,就是把提好的质粒不任何处理,再次转入感受态细胞中,然后从转化子中提取质粒,突然发现质粒条带还有,但是质粒条带下方莫名其妙地多了一个条带,请问这怎么解释呢?是不是感受态细胞污染了呢?

[ Last edited by wangdandelia on 2010-12-19 at 11:10 ]
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nuoyaeva

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2011-04-23 14:51:54
引用回帖:
Originally posted by wangdandelia at 2010-12-13 09:50:44:
各位虫友,我想请教一下,你们有没有遇到质粒转到感受态细胞后,会丢失片段的问题?
我最近遇到了一个问题,就是将质粒切开,人工插入一个片段,再连接后,转化到感受态细胞中,结果得到的新的质粒丢失了一个很大 ...

1. 结果得到的新的质粒丢失了一个很大的片段。你的酶切位点没问题吧,比如该质粒其他位置还有这个酶的位点,你核实了没?
2. 原质粒的菌体通过没有抗性的LB培养基传代培养,从而筛选一个完全丢失质粒的受体菌。 原则上讲,这个方法是有漏洞的,虽然带质粒的E.coli分裂时间长,但是还是会生长呀,最后就有可能会出现你说的那种情况,提出来的质粒,发现有2条带...
不过最好上图,看了图就可以具体问题具体分析了,我这也只能凭你说的瞎猜猜。
生活是美好的
15楼2011-04-23 13:54:25
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gundamba

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我出过这样的问题!!!后来也在小木虫上问,没得到合理的解答,后来我大批量的筛,筛出来了,但是这种情况还是有!
2楼2010-12-14 23:04:45
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adslye

银虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+1):鼓励积极参与~~~ 2010-12-23 09:19:51
这的确是很难解释的现象,但如楼上所说,很多时候我们只能大量筛。
今天实验和楼主差不多,质粒里是我的条带,就是不知道为什么顺序变了。。。
3楼2010-12-14 23:25:05
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gongeleven

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
用的质粒启动子是什么?taq启动子?
4楼2010-12-15 09:07:37
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