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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 【求助】关于PWscf在机群上并行的问题
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暖秋

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于PWscf在机群上并行的问题

前几天发过一个帖子，PWscf并行不了，谢谢大家的帮忙。现在发现是可以的，但存在以下问题，请各位帮帮忙：


       我以root身份在node1上编译的PWscf，发现只有在node1上才能检测到并行环境，在其他节点下面configure的时候检测不到并行环境。请问这是什么原因？难道要在每个节点上都装上mpi？还有，在node1并行编译后，只有以root身份在node1下面算才可以并行。在别的节点上以root身份也并行不了，用一般用户身份就更并行不了了,请问这些是什么原因引起的，能怎样解决？是不是涉及到权限的问题？请大家帮帮分析指教。。。。谢谢！
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1楼 2010-12-08 10:40:11
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暖秋

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-12-08 16:55:51:


集群上有区别，单机的话只能用root运行，不能用普通用户运行
集群上的话即使用root安装，分节点的也不能用root运行

请问您的意思是：如果在机群上用root身份安装，除了安装的节点，别的节点下是不能并行的。对吗？那是不是在机群上就只能在普通帐号下安装？可是用自己的普通帐号的话，configure也不能找到编译器，怎么回事？需要的东西都要一股脑儿地在普通帐号下安装？
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9楼2010-12-08 17:05:30
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)
暖秋(金币+1): 2010-12-08 15:48:30
引用回帖:
Originally posted by 暖秋 at 2010-12-08 10:40:11:
前几天发过一个帖子，PWscf并行不了，谢谢大家的帮忙。现在发现是可以的，但存在以下问题，请各位帮帮忙：


       我以root身份在node1上编译的PWscf，发现只有在node1上才能检测到并行环境，在其他节点下面 ...

安装pwscf不要以root身份安装
建议重新用普通用户身份安装一下，然后以普通用户登录，应该各个节点可以运行的
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2楼2010-12-08 12:00:40
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子虚乌有5388

木虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流经验 2010-12-08 15:12:58
暖秋(金币+1): 2010-12-08 15:48:33
我以普通安装在自己目录下，可以在各个节点并行使用。
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3楼2010-12-08 14:53:44
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暖秋

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-12-08 12:00:40:


安装pwscf不要以root身份安装
建议重新用普通用户身份安装一下，然后以普通用户登录，应该各个节点可以运行的

请问：你是把装PWscf所需要的并行环境，数学库等东西全部安装在自己的个人帐号下吗？
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4楼2010-12-08 15:52:28
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