| 查看: 641 | 回复: 3 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
基因结构-你知道但不一定全懂的知识
|
|||
|
1、一般真核生物基因的转录依赖于RNA聚合酶II，但它和DNA序列的结合以及转录的开始并不是随机的，它只有通过识别目的基因的特定序列（启动子）并与之结合后方能开始正确转录，基因组的结构大致如下： ＝＝GC区＝＝＝CAAT box＝＝TATA box＝＝TSS＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝AATAAA＝＝ 其中启动子主要跨越CAAT box和TATA box，RNA聚合酶II和启动子结合后就可以正常转录，不同的box作用不同，其中GC区和CAAT区主要调节转录的效率，去除这两个部分后将大大降低转录效率；而TATA box主要作用是参与转录起始位点（TSS）的确定，所以基因预测以及基因确定时可以看基因组中有无TATA box，但TATA box等序列并不是确定基因的充分必要条件，一些基因并不一定有TATA box，也未必全含上述三个box。 2、基因转录后，形成核不均一RNA（hnRNA），即mRNA的前体，其经过5加帽3加尾和内含子剪接后形成成熟mRNA。 TSS－－5UTR－－ATG＝exon＝gt－intron－ag＝exon＝……＝TAA－3UTR－AATAAA－poly（A） 内含子剪接位点有特异性序列（gt/ag），内含子剪接后，使介于起始密码子（ATG）和终止密码子（TAA，TGA，TAG）的外显子连在一起，它们是编码aa序列的ORF（open reading frame），也称为CDS（coding sequence）。从TSS到ORF为5UTR（5'Untranslated Region）区，从TAA到poly（A）为3UTR（3' Untranslated Region）。 TSS－－5UTR－－ATG＝＝＝ORF（CDS）＝＝＝TAA－3UTR－AATAAA－poly（A）site 3、在确定ATG起始密码子时，可以用到KOZAK序列，它主要指有AXXATGG结构，即ATG前－3位一般为A，ATG后为G，不过现在有一些现成的软件可以直接预测ORF，如ORF finder。 4、至于信号肽，它涉及到mRNA翻译后的蛋白是否是分泌型蛋白，如果蛋白是要分泌到胞外的，那翻译后的蛋白需要先进入内质网加工，而进入内质网需要有信号肽的引导，信号肽是蛋白质N端富含疏水氨基酸的部分序列，在等整个蛋白进入内质网后，信号肽即被切除，随后经过修饰加工后形成成熟肽，最后分泌到胞外。预测信号肽也有现成的软件可以用如SingalP。 |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有238人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
2楼2006-06-23 09:59:29
1
 |
3楼2006-08-13 17:09:32
vivalk
捐助贵宾 (著名写手)
Just so so
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 8.55
- 金币: 4485.9
- 帖子: 1106
- 在线: 57.1小时
- 虫号: 21795
- 注册: 2003-08-25
- 性别: GG
- 专业: 植物遗传学
4楼2006-08-13 21:00:52
