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erghper

铜虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 1419.8
红花: 1
帖子: 141
在线: 44.8小时
虫号: 1146544
注册: 2010-11-14
性别: GG
专业: 原子和分子物理

[交流] 【求助】如何提高下列vasp脚本的运行效率已有2人参与

for i in 3.8783 3.9283 3.9783 4.0283 4.0783 4.1283 4.1783 4.2283 4.2783 4.3283
do
cat > POSCAR < Au-fcc
$i
1.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 1.0
4
Direct
0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000
0.0000000000000000 0.4999999999999999 0.4999999999999999
0.5000000000000000 0.0000000000000000 0.4999999999999999
0.5000000000000000 0.4999999999999999 0.0000000000000000
!
echo "a = $i atom"
mpdboot
time mpirun -np 8 vasp | tee screen.log
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n",$5}'`
V=`grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.4f \n",$5}'`
echo "$i $V $E" >> comment

在调试vasp数据时遇到诸如此类问题，服务器运行起来太慢了，不知道该怎么办，求高手指导一下！！（自己的机子用一核的跑都不服务器快）

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1楼 2010-12-07 08:51:17

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erghper

铜虫 (小有名气)

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专业: 原子和分子物理

哦，谢谢
不过，我是想提高服务器的运行效率，
我算一个原子也是这样慢的速度（我是说写成这样的脚本算，但是如果用一个一个的数据来算，比如把incar，kpoints，poscar，potcar准备好算一个原子的话，几分钟九ok了，但是写成这样的要调试某个参数的脚本，运行起来九简直让人头痛阿，慢的要命，更别说算几个了原子了）
还有这个脚本提交的时候直接用sh吗？