24小时热门版块排行榜    

查看: 762  |  回复: 2

erghper

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何提高下列vasp脚本的运行效率 已有2人参与

for i in 3.8783 3.9283 3.9783 4.0283 4.0783 4.1283 4.1783 4.2283 4.2783 4.3283
do
cat > POSCAR < Au-fcc
$i
1.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 1.0
4
Direct
0.0000000000000000   0.0000000000000000   0.0000000000000000
0.0000000000000000   0.4999999999999999   0.4999999999999999
0.5000000000000000   0.0000000000000000   0.4999999999999999
0.5000000000000000   0.4999999999999999   0.0000000000000000
!
echo "a = $i atom"
mpdboot
time mpirun -np 8 vasp | tee screen.log
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n",$5}'`
V=`grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.4f \n",$5}'`
echo "$i  $V  $E"  >> comment


在调试vasp数据时遇到诸如此类问题,服务器运行起来太慢了,不知道该怎么办,求高手指导一下!!(自己的机子用一核的跑都不服务器快)
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ustbwgs

木虫 (正式写手)


bingmou(金币+1):感谢交流 2010-12-07 15:05:53
你这个脚本中的所有需要的运行都是是由VASP软件执行的,而VASP是经过多方面测试的,我们能优化它的效率吗???
还是在你的INCAR设置或者K点的选择上动脑筋吧。,
doingwhatishoulddo!
2楼2010-12-07 14:36:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

erghper

铜虫 (小有名气)

哦,谢谢
不过,我是想提高服务器的运行效率,
我算一个原子也是这样慢的速度(我是说写成这样的脚本算,但是如果用一个一个的数据来算,比如把incar,kpoints,poscar,potcar准备好算一个原子的话,几分钟九ok了,但是写成这样的要调试某个参数的脚本,运行起来九简直让人头痛阿,慢的要命,更别说算几个了原子了)
还有这个脚本提交的时候直接用sh吗?
3楼2010-12-07 15:11:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 erghper 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +3 启萌科技 2026-08-12 9/450 2026-08-13 19:29 by 启萌科技
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +8 医学老男孩 2026-08-13 18/900 2026-08-13 19:28 by Tide man
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 11/550 2026-08-13 10:40 by ZH远山
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 化学口download_prp&amp;fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见