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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】qPCR中的引物碱基对问题，为何会有奇怪的字母出现
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yellowaken

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】qPCR中的引物碱基对问题，为何会有奇怪的字母出现

本人是环境专业的，没有多少微生物学背景。最近在进行分子生物学的实验研究，最近在文献上看到primer的顺序非常的奇怪，为什么里面会有诸如T/K/M等字母，请各位高人指点。
引物RTC_F 的Sequence(5’→3’)是：ACCCTGGTCGGTGTKSTYTC
       RTC _R的Sequence(5’→3’)是：TCATGTAMGAGCCGACGAAGTC
（不会是书写错误的，因为该文献来自环境领域最权威的期刊。）
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1楼 2010-12-06 08:12:34
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)
★
yellowaken(金币+1):谢谢参与
简并引物
M 代表A or C
R 代表A or G
W代表 A or T
S代表 C or G
Y代表 C or T
K代表 G or T
V 代表A or C or G
H 代表A or C or T
D代表 A or G or T
B 代表C or G or T
N代表 G or A or T or C
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3楼2010-12-06 08:35:02
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傻子

木虫 (正式写手)
★
yellowaken(金币+1):谢谢参与
晕，这是兼并引物，这些T/K/M字母表示几个碱基而不是一个A/G/C/T。
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2楼2010-12-06 08:31:31
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