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yellowaken

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】qPCR中的引物碱基对问题,为何会有奇怪的字母出现

本人是环境专业的,没有多少微生物学背景。最近在进行分子生物学的实验研究,最近在文献上看到primer的顺序非常的奇怪,为什么里面会有诸如T/K/M等字母,请各位高人指点。
引物RTC_F 的Sequence(5’→3’)是:ACCCTGGTCGGTGTKSTYTC
       RTC _R的Sequence(5’→3’)是:TCATGTAMGAGCCGACGAAGTC
(不会是书写错误的,因为该文献来自环境领域最权威的期刊。)
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傻子

木虫 (正式写手)



yellowaken(金币+1):谢谢参与
晕,这是兼并引物,这些T/K/M字母表示几个碱基而不是一个A/G/C/T。
2楼2010-12-06 08:31:31
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)



yellowaken(金币+1):谢谢参与
简并引物
M 代表A or C
R 代表A or G
W代表 A or T
S代表 C or G
Y代表 C or T
K代表 G or T
V 代表A or C or G
H 代表A or C or T
D代表 A or G or T
B 代表C or G or T
N代表 G or A or T or C
3楼2010-12-06 08:35:02
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