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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】临时文件删了
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4010808

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】临时文件删了

大家好，我不小心把gaussian的临时文件夹下的文件G-都删了，现在gaussian运行不了，请问该怎么办，谢谢！
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1楼 2010-12-05 09:32:55
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ykwang

金虫 (正式写手)
★
heyo_123(金币+1):鼓励交流！ 2010-12-05 11:26:17
4010808(金币+1): 2010-12-05 12:35:03
你指的是删除了Gaussian的Scratch目录吧？再在原来的路径下建一个新的Scratch目录就可以了。
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2楼2010-12-05 10:28:27
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abbott

金虫 (著名写手)
re-start your job.
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3楼2010-12-05 12:21:54
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4010808

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-12-05 10:28:27:
你指的是删除了Gaussian的Scratch目录吧？再在原来的路径下建一个新的Scratch目录就可以了。

是把这个目录下的文件都删了，在网上看有的人说是临时文件夹的权限问题 可是我不会

出现的错误：
PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = ~/g09/Gau-7963.inp
In source file ml0.f, at line number 182
  --- traceback not available
/home/chem/kxk/.lsbatch/1291523676.345897: line 8:  7963 Aborted                 (core dumped) g09 ag20.com
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4楼2010-12-05 12:35:58
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ykwang

金虫 (正式写手)
4010808(金币+1): 2010-12-05 14:15:17
引用回帖:
Originally posted by 4010808 at 2010-12-05 12:35:58:


是把这个目录下的文件都删了，在网上看有的人说是临时文件夹的权限问题 可是我不会

出现的错误：
PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio -  ...

既然你能删掉文件，说明不是权限问题。我怀疑是Gaussian还在运行中你把临时文件给删了。如果是这种情况，将内存中还在运行的g03/09有关进程kill掉，再重新启动Gaussian即可。如果不会这样操作，干脆reboot机器吧。
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5楼2010-12-05 12:45:59
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lihuiran818

木虫 (小有名气)
重新安装一下
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6楼2010-12-05 13:16:00
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4010808

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-12-05 12:45:59:


既然你能删掉文件，说明不是权限问题。我怀疑是Gaussian还在运行中你把临时文件给删了。如果是这种情况，将内存中还在运行的g03/09有关进程kill掉，再重新启动Gaussian即可。如果不会这样操作，干脆reboot机器 ...

您好，是的，我是在运行中把那个删了。我是在集群上Linux下用的g09,所有进程都关了，可是再提交任务都不行了。这个应该如何处理，谢谢
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7楼2010-12-05 14:18:41
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ykwang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 4010808 at 2010-12-05 14:18:41:


您好，是的，我是在运行中把那个删了。我是在集群上Linux下用的g09,所有进程都关了，可是再提交任务都不行了。这个应该如何处理，谢谢

那就只好重新启动服务器试一试了。
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8楼2010-12-05 16:11:18
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