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auybv金虫 (小有名气)
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[交流]
【求助】Amber中同样的初始文件多次运行结果相同吗？
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| 我用Amber做了一个很大的体系的动力学模拟，每次5ns，总共运行了25ns。最近不小心把从5ns到10ns的那个mdcrd文件删了。如果还用5ns时的top和rst文件重新提交，计算到10ns时的结构和以前那次计算的会完全相同吗？Amber在进行动力学模拟的时候是否存在随机因素？因为体系太大，运行起来极其耗时，如果每次的结果都不同，那么后面的15ns也还要重新计算。谢谢。 |
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