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chinayhb

金虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】用什么软件可以建立细胞膜嵌套蛋白质体系模型

我现在想做细胞膜嵌套蛋白质的分子模拟，可是模型建立不知道用什么方法好，希望高手指导。我试了试VMD，觉得不怎么好用啊，还要手动拖拉蛋白质分子去重叠POPC膜，这样做准确吗?

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1楼2010-12-02 09:12:50

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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

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★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):thank you 2010-12-03 15:30:04

引用回帖:

Originally posted by chinayhb at 2010-12-03 09:12:56:

我找到那个小木虫的关于gromacs做膜蛋白的帖子了，是不是那个membraneprotein.doc文件？还是大侠你整理的啊，可是我下载不了啊，你能不能给我发一份啊，万分感谢，我邮箱是china0527yhb@163.com

抱歉，我找了半天也没找到那个文档。。。给你个网址你自己看吧。。。
http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... _protein/index.html
另外楼上说的那个NAMD的膜蛋白教程你也可以看看，不过我看了一遍没大看懂。。。
还有楼主，我上面说的让你搜膜蛋白，不是让你搜我这个。。。我不是高人。。。有位高人专门写了个膜蛋白用gromacs做的步骤和很多脚本。。你可以看看

[ Last edited by qzhaosdu on 2010-12-3 at 12:35 ]