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xk6891

至尊木虫 (著名写手)


[交流] 【求助】安装mpich2时如何产生mpicc及mpifort

mpich2安装好了之后没有mpicc或者mpifort啊,怎么办,下一步单机并行编译的时候需要这个东西啊,看了网上很多帖子,还是没有弄明白,大家怎么让icc成为mpicc及ifort成为mpifort的,不会是做个软链接吧,我太菜了看不懂啊
也就是如何让mpicc认定自己链接的是icc,还是gcc,及mpifort链接的是ifort还是gfortran
谢谢了

[ Last edited by xk6891 on 2010-11-29 at 08:57 ]
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qphll

金虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
xk6891(金币+5):3Q~~专家顾问~~呵呵 2010-11-29 13:19:50
ghcacj(金币+7):谢谢 2010-11-29 18:12:45
引用回帖:
Originally posted by xk6891 at 2010-11-29 12:06:33:

太感谢了,我刚刚做好,但是效率不高。原来做过一次并行lammps,是直接从新立德里面安装的openmpi,我当时不知道怎么生成的这些mpif77,mpicc这些东西。直到昨天晚上想把cpmd并行一下,一直无法成功,才发现这些 ...

首先, 啥叫"新立德", 我看到你回复有好几处, 大概能猜到, 但是想确认一下, 哈哈.

另外, 关于编译器的选择, 这个是很"为难"的事情. 从我自己的经验来讲 (没有benchmark的数据), 大概我估摸出这么几个比较优化的组合:

(1) Quantum-espresso: Intel
(2) Lammps, CPMD: PGI

或者说, 我感觉除了 Quantum-espresso 在intel下速度很满意之外, 其他的都是PGI占优.

当然, 这只是在你自己的cluster上的时候的情况. 一般大型的机器, 一般都有专门经过优化的编译器.

所以我的建议是: 在允许的范围内, 尝试几种编译器. 不管怎样, 能安装起来, 能顺利并行起来是王道, 后面的优化, 是比较tricky的, 而且, 似乎如果"太"专注优化了, 可能会带来比较大的浮点数误差. 我依稀记得有文章(或者书)说过这个, 但是忘记出处了.
9楼2010-11-29 12:24:31
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qphll

金虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★
xk6891(金币+2):谢谢专家 2010-11-29 09:49:23
ghcacj(金币+5):谢谢 2010-11-29 18:12:10
引用回帖:
Originally posted by xk6891 at 2010-11-29 08:46:33:
mpich2安装好了之后没有mpicc或者mpifort啊,怎么办,下一步单机并行编译的时候需要这个东西啊,看了网上很多帖子,还是没有弄明白,大家怎么让icc成为mpicc及ifort成为mpifort的,不会是做个软链接吧,我太菜了看 ...

(1) 先安装mpich or opemmpi

(2) 在 configure or make 你的C++或者FORTRAN的时候, 加上一些参数. 加什么, 怎么加, 参见你的编译器的manual.

比如, Intel C++, V11.0, 针对openmpi编译的时候, 加上的是:

-openmp-lib compat

你可以试试看.
2楼2010-11-29 09:37:10
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by qphll at 2010-11-29 09:37:10:


(1) 先安装mpich or opemmpi

(2) 在 configure or make 你的C++或者FORTRAN的时候, 加上一些参数. 加什么, 怎么加, 参见你的编译器的manual.

比如, Intel C++, V11.0, 针对openmpi编译的时候, 加上的是 ...

您的意思是在configure或者make的时候,加上一定的选项,定义mpicc是icc还是ifort的,我理解的对么,具体的设置需要看这个openmpi或者mpi的manual,是么
3楼2010-11-29 09:51:20
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qphll

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by xk6891 at 2010-11-29 09:51:20:

您的意思是在configure或者make的时候,加上一定的选项,定义mpicc是icc还是ifort的,我理解的对么,具体的设置需要看这个openmpi或者mpi的manual,是么

正解.
4楼2010-11-29 10:29:24
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