24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1536  |  回复: 25

wanglei200

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】ICSD里的实验模型太离谱了!已有6人参与

我把ICSD里的实验模型,进行优化计算,发现晶胞基矢变化很大啊!而且里面的几个原子离得特别近。怎么回事啊?我查了下,很多虫子也都遇到了这样的问题,盼望高手予以解答啊!!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
mazuju028(金币+1):谢谢交流 2010-11-18 12:20:42
你这么说大家也都是一头雾水啊
最好把模型和计算设置等说一下
这样可以帮助别人判断是什么问题
博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2010-11-18 11:51:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglei200

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by wanglei200 at 2010-11-18 11:20:59:
我把ICSD里的实验模型,进行优化计算,发现晶胞基矢变化很大啊!而且里面的几个原子离得特别近。怎么回事啊?我查了下,很多虫子也都遇到了这样的问题,盼望高手予以解答啊!!!

版主,你好。针对这个问题,其实,我已经发过一个帖子了。可是没有达到什么答案啊!你当时对我的回复是,实验和理论模型是有差距的。
【求助】ICSD里的模型在vasp里变化很大,怎么回事啊 。
那么,如何解决这个问题呢??谢谢版主了!!
3楼2010-11-18 12:37:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by wanglei200 at 2010-11-18 12:37:01:

版主,你好。针对这个问题,其实,我已经发过一个帖子了。可是没有达到什么答案啊!你当时对我的回复是,实验和理论模型是有差距的。
【求助】ICSD里的模型在vasp里变化很大,怎么回事啊 。
那么,如何解决这 ...

给出你的poscar看看什么情况
博学、审问、慎思、明辨、笃学
4楼2010-11-18 15:51:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglei200

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-11-18 15:51:10:


给出你的poscar看看什么情况

O   Al   Mo
    1.000000000000000
    11.4308753431176500    0.0000000000000000   13.1917335714662700
     0.0000000000000000 -122.0598269414434000    0.0000000000000000
   -17.6402870367433200    0.0000000000000000  -51.2550163559398900
  94  16  24
Selective dynamics
Direct
  0.0837678693152686  0.8523189941229541  0.4200689859336397   T   T   T
  0.0837678693152686 -0.8523189941229541  0.4200689859336397   T   T   T
  0.3646333337811434  0.4674768987508230  0.2929969636998263   T   T   T
  0.3646333337811434 -0.4674768987508230  0.2929969636998263   T   T   T
  0.1747165893026023  0.3350804809234459  0.2355316761339919   T   T   T
  0.1747165893026023 -0.3350804809234459  0.2355316761339919   T   T   T
  0.3523000175783487  0.2164938416176648  0.0617000345120567   T   T   T
  0.3523000175783487 -0.2164938416176648  0.0617000345120567   T   T   T
  0.6614110461050185  0.1836931624653192  0.0274833415168223   T   T   T
  0.6614110461050185 -0.1836931624653193  0.0274833415168223   T   T   T
  0.7254670650285928  0.3714000040607246  0.6976779571136833   T   T   T
  0.7254670650285928 -0.3714000040607246  0.6976779571136833   T   T   T
  0.6635848316650623  0.6509557173668952  0.7286900184489658   T   T   T
  0.6635848316650623 -0.6509557173668952  0.7286900184489658   T   T   T
  0.8905856760080324  0.8083401241559059  0.5388310190543908   T   T   T
  0.8905856760080324 -0.8083401241559059  0.5388310190543908   T   T   T
-0.5189105342310244  0.7690373810495209 -0.8264955574299869   T   T   T
-0.5189105342310244  0.2309626189504792 -0.8264955574299869   T   T   T
  0.1464121523109677  0.3639470593018788  0.3806022272055333   T   T   T
  0.1464121523109677  0.6360529406981211  0.3806022272055333   T   T   T
  0.1484358125359922  0.8556783626204377  0.2513085276539373   T   T   T
  0.1484358125359922  0.1443216373795626  0.2513085276539373   T   T   T
  0.3515786429358326  0.3769118700363387  0.2186371516423810   T   T   T
  0.3515786429358326  0.6230881299636612  0.2186371516423810   T   T   T
  0.3571227994729810  0.8663322328507215  0.1367245183565363   T   T   T
  0.3571227994729810  0.1336677671492785  0.1367245183565363   T   T   T
  0.3068270170852933  0.1577255298888863  0.9410494991243926   T   T   T
  0.3068270170852933  0.8422744701111137  0.9410494991243926   T   T   T
  0.7418324824922094  0.1473350698020742 -0.9105127648223903   T   T   T
  0.7418324824922094  0.8526649301979258 -0.9105127648223903   T   T   T
  0.6396797647801151  0.8749982729236093  0.8605093368794396   T   T   T
  0.6396797647801151  0.1250017270763906  0.8605093368794396   T   T   T
  0.6500969144081616  0.3922763319315296  0.7595334002839284   T   T   T
  0.6500969144081616  0.6077236680684707  0.7595334002839284   T   T   T
  0.8642387227870106  0.8905313080070581  0.7450566917259108   T   T   T
  0.8642387227870106  0.1094686919929421  0.7450566917259108   T   T   T
  0.8533852730187913  0.3706757905659357  0.6224718557665582   T   T   T
  0.8533852730187913  0.6293242094340643  0.6224718557665582   T   T   T
  0.5835539160361832  0.8147200554383684  0.8882464593671218   T   T   T
  0.5835539160361832  0.1852799445616316  0.8882464593671182   T   T   T
  0.0081713481676826  0.6823712987727064  0.6408808086747849   T   T   T
  0.0081713481676826 -0.6823712987727063  0.6408808086747849   T   T   T
  0.1182422729419765  0.6620319587894002  0.6153718999872563   T   T   T
  0.1182422729419765  0.3379680412105997  0.6153718999872563   T   T   T
  0.2757047125578723 -0.9927538633859092  0.5351060006074992   T   T   T
  0.2757047125578723  0.9927538633859092  0.5351060006074992   T   T   T
-0.1096435486837650  0.6978661533877503 -0.2991572301778720   T   T   T
-0.1096435486837650  0.3021338466122497 -0.2991572301778720   T   T   T
  0.0140678716269602  0.5717065267651112 -0.3545381298209961   T   T   T
  0.0140678716269602  0.4282934732348888 -0.3545381298209961   T   T   T
  0.4293729658287766  0.8800756204399827  0.4283112555679041   T   T   T
  0.4293729658287766  0.1199243795600173  0.4283112555679041   T   T   T
  0.1859346146718619  0.2532718344453122  0.4211096656041896   T   T   T
  0.1859346146718619  0.7467281655546878  0.4211096656041896   T   T   T
  0.5345114483752949  0.1354475749115898  0.3591552788118284   T   T   T
  0.5345114483752949  0.8645524250884103  0.3591552788118284   T   T   T
  0.1152698707859625  0.8809449665636345  0.3141242868405866   T   T   T
  0.1152698707859625  0.1190550334363654  0.3141242868405866   T   T   T
  0.9601597497704647  0.2621405611457617  0.3160576915911486   T   T   T
  0.9601597497704647  0.7378594388542382  0.3160576915911486   T   T   T
  0.6645971534308011  0.0999412000573199  0.2936149390079674   T   T   T
  0.6645971534308011  0.9000587999426802  0.2936149390079674   T   T   T
  0.7344053564435564 -0.1409616192152296  0.2691436603433905   T   T   T
  0.7344053564435564  0.1409616192152296  0.2691436603433905   T   T   T
  0.1806655761376438  0.7423206037877605  0.2544397466222303   T   T   T
  0.1806655761376438  0.2576793962122394  0.2544397466222303   T   T   T
  0.8562813891757132  0.6023101305199416  0.2354100876171190   T   T   T
  0.8562813891757132  0.3976898694800584  0.2354100876171190   T   T   T
  0.3417979014755643  0.2053387228953532  0.2184582644918586   T   T   T
  0.3417979014755643  0.7946612771046468  0.2184582644918586   T   T   T
  0.7465753553937762  0.6954759936595956  0.2027096398061024   T   T   T
  0.7465753553937762 -0.6954759936595956  0.2027096398061024   T   T   T
  0.9748315892725836  0.5504419442416479  0.1724997926468014   T   T   T
  0.9748315892725836  0.4495580557583521  0.1724997926468014   T   T   T
  0.5368806818159882  0.6100238893946768  0.1594501193063215   T   T   T
  0.5368806818159882  0.3899761106053233  0.1594501193063215   T   T   T
  0.3565692006289506  0.3733520544255726  0.1460857476223672   T   T   T
  0.3565692006289506  0.6266479455744274  0.1460857476223672   T   T   T
-0.0108416049308245  0.2509224924660803  0.1773216749112756   T   T   T
-0.0108416049308245  0.7490775075339197  0.1773216749112756   T   T   T
  0.8319122317500211  0.8033496626052262  0.0989040097043186   T   T   T
  0.8319122317500211  0.1966503373947741  0.0989040097043186   T   T   T
  0.1333987555266515  0.5440624769684279  0.0137370895438994   T   T   T
  0.1333987555266515  0.4559375230315720  0.0137370895438994   T   T   T
  0.7855767750650056  0.5000000000000000  0.0579807615243957   T   T   T
  0.8246405585655920 -0.3254167374557253  0.3208998398788633   T   T   T
  0.8246405585655920  0.3254167374557253  0.3208998398788633   T   T   T
  0.1511031031180438 -0.3604925332547434  0.6622527769122330   T   T   T
  0.1511031031180438  0.3604925332547434  0.6622527769122330   T   T   T
  0.2130947809890997  0.5000000000000000  0.9326358486576808   T   T   T
  0.7314506471391368  0.4424478123984555  0.2869304317333513   T   T   T
  0.7314506471391368  0.5575521876015444  0.2869304317333513   T   T   T
  0.1360076636402470  0.7808708744938299  0.8893121713705863   T   T   T
  0.1360076636402470  0.2191291255061701  0.8893121713705863   T   T   T
  0.2292019424667707 -0.0271780078413871  0.6316783526051627   T   T   T
  0.2292019424667707  0.0271780078413872  0.6316783526051627   T   T   T
  0.6810624209065718  0.2577069054476982  0.8006020919656047   T   T   T
  0.6810624209065718  0.7422930945523017  0.8006020919656047   T   T   T
  0.4042090791951015  0.9510867265617856  0.8080187070110160   T   T   T
  0.4042090791951015  0.0489132734382143  0.8080187070110160   T   T   T
  0.0750103010104136  0.6908782074795900  0.8124093744446014   T   T   T
  0.0750103010104136  0.3091217925204099  0.8124093744446014   T   T   T
  0.2552545227917719  0.8562921489985287  0.8056103606402029   T   T   T
  0.2552545227917719 -0.8562921489985287  0.8056103606402029   T   T   T
  0.6620457627475385  0.1878664162351918  0.7925065785336527   T   T   T
  0.6620457627475385  0.8121335837648084  0.7925065785336527   T   T   T
  0.1406187280349775  0.6060995106502586  0.7686281779939553   T   T   T
  0.1406187280349775  0.3939004893497413  0.7686281779939553   T   T   T
  0.7676467005245807  0.7353465391850007  0.7012238910298927   T   T   T
  0.7676467005245807  0.2646534608149993  0.7012238910298927   T   T   T
  0.2628530719781366 -0.2281565815465399  0.7260235939969744   T   T   T
  0.2628530719781366  0.2281565815465399  0.7260235939969744   T   T   T
  0.3417581645826017  0.3654899736202216  0.7024455192256590   T   T   T
  0.3417581645826017  0.6345100263797786  0.7024455192256590   T   T   T
  0.0783183631914152  0.5310019170952836  0.7092001765640291   T   T   T
  0.0783183631914152  0.4689980829047163  0.7092001765640291   T   T   T
  0.9466566468825446  0.0273291592192060  0.8253042993452773   T   T   T
  0.9466566468825446 -0.0273291592192060  0.8253042993452773   T   T   T
  0.4364609987205450  0.4418915189962221  0.6344115082562896   T   T   T
  0.4364609987205450  0.5581084810037779  0.6344115082562896   T   T   T
  0.7493525611022354  0.4679467400534980  0.4654486443030084   T   T   T
  0.7493525611022354  0.5320532599465019  0.4654486443030084   T   T   T
  0.5677264008954927  0.8067011939769204  0.5489878304253696   T   T   T
  0.5677264008954927  0.1932988060230797  0.5489878304253696   T   T   T
  0.9677782580080001  0.5980575712412453  0.3554883628383678   T   T   T
  0.9677782580080001  0.4019424287587546  0.3554883628383678   T   T   T
  0.1061057010431812  0.6970548369586678  0.2971305248914936   T   T   T
  0.1061057010431812  0.3029451630413322  0.2971305248914936   T   T   T
  0.7116141645717077 -0.6089665855814424  0.4516136181081340   T   T   T
  0.7116141645717077  0.6089665855814424  0.4516136181081340   T   T   T
  0.8138016864767909  0.6135147719936617  0.3252220476164467   T   T   T
  0.8138016864767909  0.3864852280063383  0.3252220476164467   T   T   T
  0.0404024897994547  0.7565705285287333  0.3950351737420732   T   T   T
  0.0404024897994547 -0.7565705285287333  0.3950351737420732   T   T   T
5楼2010-11-19 08:22:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglei200

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-11-18 15:51:10:


给出你的poscar看看什么情况

以上的是驰豫结束后的CONTCAR。多谢版主了!
6楼2010-11-19 08:24:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by wanglei200 at 2010-11-19 08:24:09:


以上的是驰豫结束后的CONTCAR。多谢版主了!

你做的是结构优化吗?为什么所有的分数坐标全部固定了?只优化原胞?
博学、审问、慎思、明辨、笃学
7楼2010-11-19 08:34:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
再有,你的Al Mo O 的比例应该是2:3:12吗?
为什么你指定的是16:24:94?这个是什么
博学、审问、慎思、明辨、笃学
8楼2010-11-19 08:38:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

引用回帖:
Originally posted by wanglei200 at 2010-11-19 08:22:17:

O   Al   Mo
    1.000000000000000
    11.4308753431176500    0.0000000000000000   13.1917335714662700
     0.0000000000000000 -122.0598269414434000    0.0000000000000000
   -17.6402870367433200    0.0000000000000000  -51.2550163559398900
  94  16  24
Selective dynamics
Direct
  0.0837678693152686  0.8523189941229541  0.4200689859336397   T   T   T
  0.0837678693152686 -0.8523189941229541  0.4200689859336397   T   T   T
  0.3646333337811434  0.4674768987508230  0.2929969636998263   T   T   T

为什么O Al Mo比例是94:16:24?
博学、审问、慎思、明辨、笃学
9楼2010-11-19 08:39:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglei200

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-11-19 08:39:39:


为什么O Al Mo比例是94:16:24?

这是CISD数据库里的模型。Al Mo O的化学式中数目比为:2:3:12。我把cif文件导入MS,后又导入VASP中。就是这样的数据了!还有,我在INCAR中设的是ISIF=3.,NSW=100.IBRION=2。
10楼2010-11-19 09:44:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wanglei200 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见